RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Actrt3Q8BXF8 369 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem38bQ9DAV9 292 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Alyref2Q9JJW6 218 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rnf212bD3Z423 297 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp961E9Q4R5 444 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr893K7N678 312 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AanatO88816 205 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Klk1b1P00755 261 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MdkP12025 140 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Abcd3P55096 659 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ErhP84089 104 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 XylbQ3TNA1 551 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 1700066B19RikQ3TS39 127 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defb46Q4QY34 57 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 DgkzQ80UP3 929 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TprkbQ8QZZ7 175 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1501Q8VFQ3 315 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf593Q9DB42 134 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r63Q9EPT1 300 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr944Q9EQ91 311 aa9.88□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm8797A0A0A6YW67 77 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tbx15O70306 602 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hoxb3P09026 433 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hist1h1bP43276 223 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rps27aP62983 156 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Uba52P62984 128 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rasl12Q08AT1 266 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tle4Q62441 773 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1111Q7TR55 312 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fbxo5Q7TSG3 421 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r6Q8R2D4 303 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lrrc26Q91W20 331 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Reep6Q9JM62 201 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Raet1aO08602 253 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Raet1bO08603 253 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dll3O88516 592 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Neil2Q6R2P8 329 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cept1Q8BGS7 416 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr720Q8VF37 316 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ripply3Q924S9 152 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defb5Q9EPV9 64 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ltbp2O08999 1813 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm35060A0A140LIV7 231 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccdc9bA3KGF9 545 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Raet1cO08604 253 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bloc1s1O55102 125 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P2rx1P51576 399 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 NcanP55066 1268 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r11Q3SXA2 299 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fbxw20Q5U467 468 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fbxo27Q6DIA9 280 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1509Q7TQQ0 308 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Peli1Q8C669 418 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r19Q8R2C7 308 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr137Q8VFC2 312 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tnfsf13Q9D777 241 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TslpQ9JIE6 140 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bex3Q9WTZ9 124 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Greb1lB9EJV3 1913 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cd200O54901 278 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fosl2P47930 326 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rap2bP61226 183 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PilrbQ2YFS2 224 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Acsf3Q3URE1 583 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r195Q5SVD6 316 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cramp1Q6PG95 1285 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1014Q7TR95 305 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1013Q7TR96 305 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 StgQ8BM15 349 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cd177Q8R2S8 817 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CytipQ91VY6 359 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cd209aQ91ZX1 238 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 WacQ924H7 646 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ascl3Q9JJR7 174 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kcne5Q9QZ26 143 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trex2Q9R1A9 236 aa9.87□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1006A2ALD2 312 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P01669 111 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zp3P10761 424 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Timm8bP62077 83 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Taar3Q5QD16 343 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrps23Q8VE22 177 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sf3b5Q923D4 86 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mien1Q9CQ86 115 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ClpsQ9CQC2 113 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pdzk1ip1Q9CQH0 114 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dnmt3lQ9CWR8 421 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem269Q9D4Y8 254 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 1700080O16RikQ9D9G4 284 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r47Q9EQ51 310 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm5916G5E8W5 102 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ppt2O35448 302 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cst3P21460 140 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nat2P50295 290 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nkx6-3Q3UHX8 262 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gins3Q9CY94 216 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fzd5Q9EQD0 585 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tnfsf14Q9QYH9 239 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Btbd35f17L7MU81 498 aa9.86□□□□□ -0.83
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ascl5M0QWB7 188 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.2 ms