RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641815.1

STX3-208, Transcript of syntaxin 3, human

BASIC

Gene STX3, Length 3,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX3-208	ENST00000641815	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	CMC2	Q9NRP2	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	TBL1X	O60907	577 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	C1orf105	O95561	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	PMS2P2	O95744	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RLN2	P04090	185 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	IRF1	P10914	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	FAH	P16930	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SERPINA2	P20848	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	CFP	P27918	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	CEACAM6	P40199	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	PTH2R	P49190	550 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	FOXL2	P58012	376 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RAB5B	P61020	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SORD	Q00796	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	NHLH2	Q02577	135 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SYPL1	Q16563	259 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ACKR1	Q16570	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	LINC00303	Q3SY05	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RNF212	Q495C1	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	TMEM25	Q86YD3	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	FRY	Q5TBA9	3013 aa		4.61	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	IFITM5	A6NNB3	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	BHLHE40	O14503	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	FGF16	O43320	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	OR2J2	O76002	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	VPREB1	P12018	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	HSPB3	Q12988	150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ECH1	Q13011	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	CDK5R1	Q15078	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	GABRA6	Q16445	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	GHSR	Q92847	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	RAB8B	Q92930	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SPEG	Q15772	3267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815		H7C417	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	OR8U9	P0C7N5	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ADH5	P11766	374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZNF35	P13682	527 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	BMP7	P18075	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	BCKDHB	P21953	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	BMP5	P22003	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SLC2A5	P22732	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	TNFRSF4	P43489	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	P2RX1	P51575	399 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	HCCS	P53701	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	H2BFS	P57053	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZNF85	Q03923	595 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	GGTLC2	Q14390	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
STX3-208	ENST00000641815	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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