RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP37Q8NFH4 326 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM171Q8WVE6 324 aa21.27■■□□□ 1
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CAPNS1-215ENST00000628018 RNF170Q96K19 258 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 CST11Q9H112 138 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 NDRG3Q9UGV2 375 aa21.27■■□□□ 1
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CAPNS1-215ENST00000628018 A6NJ64 397 aa21.26■□□□□ 0.99
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CAPNS1-215ENST00000628018 ACBD4Q8NC06 268 aa21.22■□□□□ 0.99
CAPNS1-215ENST00000628018 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CAPNS1-215ENST00000628018 NICN1Q9BSH3 213 aa21.22■□□□□ 0.99
CAPNS1-215ENST00000628018 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CAPNS1-215ENST00000628018 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
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