RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PRODHO43272 600 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 DCTN3O75935 186 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 GINS1Q14691 196 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 FBLN7Q53RD9 439 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 CEP78Q5JTW2 689 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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PTPRF-216ENST00000617451 RAB18Q9NP72 206 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 C19orf12Q9NSK7 152 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRF-216ENST00000617451 NOTCH3Q9UM47 2321 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRF-216ENST00000617451 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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PTPRF-216ENST00000617451 MKXQ8IYA7 352 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf44Q8N8P7 122 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRF-216ENST00000617451 OR5A2Q8NGI9 324 aa20.26■□□□□ 0.83
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PTPRF-216ENST00000617451 ITFG2Q969R8 447 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRF-216ENST00000617451 RASL12Q9NYN1 266 aa20.26■□□□□ 0.83
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PTPRF-216ENST00000617451 OR5B21A6NL26 309 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTPRF-216ENST00000617451 KRT77Q7Z794 578 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTPRF-216ENST00000617451 LAMP5Q9UJQ1 280 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRF-216ENST00000617451 DNAH3Q8TD57 4116 aa20.24■□□□□ 0.83
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PTPRF-216ENST00000617451 C11orf42Q8N5U0 333 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRF-216ENST00000617451 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa20.24■□□□□ 0.83
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PTPRF-216ENST00000617451 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa20.23■□□□□ 0.83
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PTPRF-216ENST00000617451 CHID1Q9BWS9 393 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa20.22■□□□□ 0.83
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PTPRF-216ENST00000617451 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa20.22■□□□□ 0.83
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PTPRF-216ENST00000617451 YIPF3Q9GZM5 350 aa20.22■□□□□ 0.83
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PTPRF-216ENST00000617451 OSMP13725 252 aa20.21■□□□□ 0.83
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PTPRF-216ENST00000617451 GSC2O15499 205 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRF-216ENST00000617451 VSIG10L2P0DP72 767 aa20.2■□□□□ 0.82
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PTPRF-216ENST00000617451 PRDX2P32119 198 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRF-216ENST00000617451 COMMD2Q86X83 199 aa20.2■□□□□ 0.82
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF488Q96MN9 340 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRF-216ENST00000617451 TEAD3Q99594 435 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRF-216ENST00000617451 MROQ9BYG7 248 aa20.2■□□□□ 0.82
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PTPRF-216ENST00000617451 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa20.19■□□□□ 0.82
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