RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611841.1

EP400-208, Transcript of E1A binding protein p400, human

TSL 5

Gene EP400, Length 3,129 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP400-208	ENST00000611841	TOMM20	Q15388	145 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841		Q6ZRG5	221 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	TAAR9	Q96RI9	348 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	PRR13	Q9NZ81	148 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841		F8VVB4	439 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841		F8VWA3	439 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	TTR	P02766	147 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	FCGR3A	P08637	254 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	PI3	P19957	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	PHF19	Q5T6S3	580 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	FAM166A	Q6J272	317 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	ST8SIA1	Q92185	356 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	RAB22A	Q9UL26	194 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	FAM186A	A6NE01	2351 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	C10orf142	B7Z368	130 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	EFNA2	O43921	213 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	GDF9	O60383	454 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	STK17B	O94768	372 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	OR2C1	O95371	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	OR13C7	P0DN81	318 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	ZNF43	P17038	809 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	SLC6A9	P48067	706 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	CEBPG	P53567	150 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	ARFRP1	Q13795	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	KHDC3L	Q587J8	217 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	GUSBP11	Q6P575	273 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	KCNK17	Q96T54	332 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	PHB2	Q99623	299 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	NICN1	Q9BSH3	213 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	VSIG4	Q9Y279	399 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841		A0A1W2PP11	408 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	ZNF727	A8MUV8	499 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	UMAD1	C9J7I0	102 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841		F5H5K5	113 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	RAB27B	O00194	218 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	SOD3	P08294	240 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	FAM57B	Q71RH2	274 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	RARRES3	Q9UL19	164 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	LIPT2	A6NK58	231 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841		H0YIZ8	118 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	PPP1R2P9	O14990	202 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	CRH	P06850	196 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	VSIG8	P0DPA2	414 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	KLK2	P20151	261 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	ZNF616	Q08AN1	781 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	NME2P1	O60361	137 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	RAMP1	O60894	148 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	C4orf17	Q53FE4	359 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	MR1	Q95460	341 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	CYYR1	Q96J86	154 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	PRRT1	Q99946	306 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	RNF126	Q9BV68	326 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	GPR84	Q9NQS5	396 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	FRYL	O94915	3013 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	EREG	O14944	169 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EP400-208	ENST00000611841	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79

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