RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596365.5

LINC00649-208, long intergenic non-protein coding RNA 649, human

TSL 5

Gene LINC00649, Length 682 nt, Biotype antisense RNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00649-208	ENST00000596365	OR52B2	Q96RD2	323 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	TMEM210	A6NLX4	147 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	C17orf98	A8MV24	154 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365		M0QZK8	103 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	SOCS2	O14508	198 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	NDUFAB1	O14561	156 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	SLC25A17	O43808	307 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	OR2F2	O95006	317 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	PSG2	P11465	335 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	GLRA1	P23415	457 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	OR3A4P	P47883	348 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	INSL3	P51460	131 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	CRYBA2	P53672	197 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	IL18R1	Q13478	541 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	SATL1	Q86VE3	508 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	DPP10	Q8N608	796 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	COMMD1	Q8N668	190 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	OR2T27	Q8NH04	317 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	OR8U1	Q8NH10	309 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	NDNF	Q8TB73	568 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	LZIC	Q8WZA0	190 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	SPSB4	Q96A44	273 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	TSSK2	Q96PF2	358 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	C1orf21	Q9H246	121 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	ZNF222	Q9UK12	451 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	DCTN6	O00399	190 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	NDUFB2	O95178	105 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	RBP4	P02753	201 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	AMY1A	P04745	511 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	AMY2A	P04746	511 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	HCK	P08631	526 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	ANOS1	P23352	680 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	BRS3	P32247	399 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	GPR4	P46093	362 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	OR1E2	P47887	323 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	ARHGDIB	P52566	201 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	DLX6	P56179	175 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	SLC35B1	P78383	322 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	FAM3A	P98173	230 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	ZNF273	Q14593	569 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	SNCB	Q16143	134 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	LCN8	Q6JVE9	175 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	ZNF561	Q8N587	486 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	STMN2	Q93045	179 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	KIRREL1	Q96J84	757 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	PRRC1	Q96M27	445 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	CDRT15	Q96T59	188 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	YY1AP1	Q9H869	796 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	ABCB9	Q9NP78	766 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	THAP1	Q9NVV9	213 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	B9D1	Q9UPM9	204 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	SLC1A7	O00341	560 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	CDC42EP2	O14613	210 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	RGS13	O14921	159 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	TBX1	O43435	398 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	TXNDC12	O95881	172 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	HLA-DQA2	P01906	255 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	CD24	P25063	80 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	RPS6KA3	P51812	740 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	MTPN	P58546	118 aa		6.66	□□□□□ -1.34
LINC00649-208	ENST00000596365	KIR2DS1	Q14954	304 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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