RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF573Q86YE8 665 aa14.84□□□□□ -0.03
ZNF548-204ENST00000594693 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.84□□□□□ -0.03
ZNF548-204ENST00000594693 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ZNF548-204ENST00000594693 AQP3Q92482 292 aa14.84□□□□□ -0.03
ZNF548-204ENST00000594693 SPSB1Q96BD6 273 aa14.84□□□□□ -0.03
ZNF548-204ENST00000594693 TIMD4Q96H15 378 aa14.84□□□□□ -0.03
ZNF548-204ENST00000594693 DERL3Q96Q80 235 aa14.84□□□□□ -0.03
ZNF548-204ENST00000594693 OR14A2Q96R54 314 aa14.84□□□□□ -0.03
ZNF548-204ENST00000594693 TMED9Q9BVK6 235 aa14.84□□□□□ -0.03
ZNF548-204ENST00000594693 DYSFO75923 2080 aa14.83□□□□□ -0.03
ZNF548-204ENST00000594693 A0A087WXM4 84 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 WNT9BO14905 357 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 PIN1P1O15428 100 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SULT1B1O43704 296 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 INMTO95050 263 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 IGHV2-70P01814 119 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SSX1Q16384 188 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 AVPI1Q5T686 147 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 NPRL2Q8WTW4 380 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 THRSPQ92748 146 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 PPIAL4DF5H284 164 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 H7C1Q1 480 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 RHBDL1O75783 438 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 RAB3AP20336 220 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 MPZP25189 248 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TGFBR2P37173 567 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 HAAOP46952 286 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 RBP2P50120 134 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 MTCP1P56278 107 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 BTG1P62324 171 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 INSL4Q14641 139 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ZMYND11Q15326 602 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TRAM1Q15629 374 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 FAM201AQ5SY85 155 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 CALHM1Q8IU99 346 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 LRRC29Q8WV35 223 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM203Q969S6 136 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ORAI1Q96D31 301 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 BORCS8Q96FH0 119 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 PKIBQ9C010 78 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM165Q9HC07 324 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 NEK6Q9HC98 313 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 A0A1W2PPK0 400 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 J3QT63 122 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ALDOBP05062 364 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 FSTP19883 344 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 GABRA5P31644 462 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ATP1B3P54709 279 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 RNF144BQ7Z419 303 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 COX4I2Q96KJ9 171 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 NOX4Q9NPH5 578 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SRRM5B3KS81 715 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 LGALS8O00214 317 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 CCRL2O00421 344 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 SYNGR1O43759 233 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF205O95201 554 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF548-204ENST00000594693 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms