RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569252.5

USB1-215, Transcript of U6 snRNA biogenesis phosphodiesterase 1, human

TSL 4

Gene USB1, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USB1-215	ENST00000569252	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	DOC2B	Q14184	412 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	UBE2V2	Q15819	145 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	SATL1	Q86VE3	508 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252		Q96MF0	132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	DERL3	Q96Q80	235 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	NOX4	Q9NPH5	578 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	HIVEP2	P31629	2446 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	MEGF11	A6BM72	1044 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	ALX3	O95076	343 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	HPX	P02790	462 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	CSF3	P09919	207 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	PDLIM4	P50479	330 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	MAB21L1	Q13394	359 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	SSX1	Q16384	188 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	GPR141	Q7Z602	305 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	GPER1	Q99527	375 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	STUB1	Q9UNE7	303 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	CUBN	O60494	3623 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	LRP5L	A4QPB2	252 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	GABRP	O00591	440 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	SMIM18	P0DKX4	95 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	SRM	P19623	302 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	BDKRB2	P30411	391 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	THBS2	P35442	1172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	RANBP1	P43487	201 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	GATA4	P43694	442 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	HAAO	P46952	286 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	FABP5	Q01469	135 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	TIMD4	Q96H15	378 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	GCM1	Q9NP62	436 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	TREM2	Q9NZC2	230 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	PLCE1	Q9P212	2302 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	NDUFS7	O75251	213 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	GPX5	O75715	221 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	MAS1	P04201	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	ALDOB	P05062	364 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	MYL9	P24844	172 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	COL8A2	P25067	703 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	PSMD7	P51665	324 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	TMEM33	P57088	247 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	S100A13	Q99584	98 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	CHODL	Q9H9P2	273 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	USF3	Q68DE3	2245 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	CDIPT	O14735	213 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	PDCD5	O14737	125 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	NCR1	O76036	304 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	LY6H	O94772	140 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	UCHL1	P09936	223 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	ZNF154	Q13106	437 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	MKX	Q8IYA7	352 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-215	ENST00000569252	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24

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