RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 OR10S1Q8NGN2 331 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 CPT1CQ8TCG5 803 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 SARAFQ96BY9 339 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 SLAMF6Q96DU3 332 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 SMCO4Q9NRQ5 59 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 MGAT4CQ9UBM8 478 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 ZNF281Q9Y2X9 895 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 IGF2RP11717 2491 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 SLC22A20A6NK97 555 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 PNPP00491 289 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 ADCYAP1P18509 176 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 PITPNBP48739 271 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 HNF4GQ14541 408 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 CEACAM19Q7Z692 300 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 PRSS35Q8N3Z0 413 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa15.49■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 SHISA3A0PJX4 238 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 OR4C45A6NMZ5 311 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 ELK1P19419 428 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 MPGP29372 298 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 GNG10P50151 68 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 FAM27D1Q5T7N8 215 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 OR5AK2Q8NH90 309 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 R3HDM4Q96D70 268 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 C4orf45Q96LM5 186 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 LUZP4Q9P127 313 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 A0A087X0M5 115 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 A0A1B0GX30 115 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 TSTD3H0UI37 97 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 RER1O15258 196 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 IGHV3-9P01782 118 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 H2BFMP0C1H6 154 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 DYRK1AQ13627 763 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 WDR38Q5JTN6 314 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 FAM27BQ5VT28 67 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 TOMM5Q8N4H5 51 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 PHYHIPLQ96FC7 376 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 GPR35Q9HC97 309 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 GAB2Q9UQC2 676 aa15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 MT-ND4LP03901 98 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 RPA2P15927 270 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 MGMTP16455 207 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 KIR3DL2P43630 455 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 PPT1P50897 306 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 CCR6P51684 374 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 BLOC1S1P78537 153 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 CEACAM16Q2WEN9 425 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 PYY3Q5JQD4 70 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 TPRA1Q86W33 373 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 LRRC18Q8N456 261 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 LINC00470Q9BZP3 86 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 SLC7A10Q9NS82 523 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 TMEM38BQ9NVV0 291 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 CRHP06850 196 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 FCGR2AP12318 317 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 CCR9P51686 369 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 GMFBP60983 142 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 PPP1R14AQ96A00 147 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 CHIAQ9BZP6 476 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 GP6Q9HCN6 339 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 CLCF1Q9UBD9 225 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 R4GMQ9 66 aa15.47■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 TMEM212A6NML5 194 aa15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 ARPC5O15511 151 aa15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 GATBO75879 557 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 LINC00614P0C842 121 aa15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 NPBWR1P48145 328 aa15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 ZNF676Q8N7Q3 588 aa15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 OR14A2Q96R54 314 aa15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 FOXB1Q99853 325 aa15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 COMMD4Q9H0A8 199 aa15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 SLC22A13Q9Y226 551 aa15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 EMC9Q9Y3B6 208 aa15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 NCOR2Q9Y618 2525 aa15.46■□□□□ 0.07
GDE1-203ENST00000564172 A0A1W2PPK0 400 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-203ENST00000564172 ZNF878C9JN71 531 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-203ENST00000564172 DCTDP32321 178 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-203ENST00000564172 CATSPERDQ86XM0 798 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-203ENST00000564172 TEX19Q8NA77 164 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-203ENST00000564172 GJC3Q8NFK1 279 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-203ENST00000564172 ASB13Q8WXK3 278 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-203ENST00000564172 APH1AQ96BI3 265 aa15.45■□□□□ 0.06
GDE1-203ENST00000564172 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms