RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563473.1

RPL4-204, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 3

Gene RPL4, Length 475 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-204	ENST00000563473	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	TPK1	Q9H3S4	243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	CA10	Q9NS85	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	ACER3	Q9NUN7	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL4-204	ENST00000563473		A0A096LNT2	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473		G3V2L1	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473		H3BN98	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	VAMP5	O95183	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	HPR	P00739	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	OR12D1	P0DN82	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	NPR2	P20594	1047 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	M6PR	P20645	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	CEACAM3	P40198	252 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	AQP2	P41181	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	MAP3K8	P41279	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	ATP1B3	P54709	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	NHLH2	Q02577	135 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	SKP2	Q13309	424 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	FOXE3	Q13461	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	HNF4G	Q14541	408 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	TRAM2	Q15035	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	OR7A5	Q15622	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	CADM2	Q8N3J6	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	SVOPL	Q8N434	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	TEX29	Q8N6K0	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	SFXN5	Q8TD22	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	SDF2	Q99470	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	OR51I1	Q9H343	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	C1orf198	Q9H425	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473		V9GYQ6	96 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62	1e-9	■■■■□ 23.3
RPL4-204	ENST00000563473	CAD	P27708	2225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL4-204	ENST00000563473	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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