RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2T7	P0C7T2	308 aa		17.95	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	IKZF1	Q13422	519 aa		17.95	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PDCD1	Q15116	288 aa		17.95	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CDON	Q4KMG0	1287 aa		17.95	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	MOB3C	Q70IA8	216 aa		17.95	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	C3orf56	Q8N813	242 aa		17.95	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		17.95	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2T27	Q8NH04	317 aa		17.95	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		17.95	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	NLK	Q9UBE8	527 aa		17.95	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	KPTN	Q9Y664	436 aa		17.95	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	NRAS	P01111	189 aa		17.94	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL1	P22362	96 aa		17.94	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	GLRA1	P23415	457 aa		17.94	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TMED1	Q13445	227 aa		17.94	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	17.94	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	DGUOK	Q16854	277 aa		17.94	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		17.94	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		17.94	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TBX5	Q99593	518 aa		17.94	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		17.94	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF222	Q9UK12	451 aa		17.94	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		17.94	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		17.94	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2AT4	A6NND4	320 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	SIGLEC5	O15389	551 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	APOL3	O95236	402 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV1-69	P01742	117 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	IL13RA1	P78552	427 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXL1	Q12952	345 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6YL49	198 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2F	Q969M7	185 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	MED30	Q96HR3	178 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	NOX4	Q9NPH5	578 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	USE1	Q9NZ43	259 aa		17.93	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	DLGAP1	O14490	977 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	SULT1C4	O75897	302 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT8	P05787	483 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PSG2	P11465	335 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC42	P60953	191 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	RORB	Q92753	470 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	LHX4	Q969G2	390 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	RFK	Q969G6	155 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		17.92	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GVI7	797 aa		17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL15	A6NJ78	407 aa		17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	EI24	O14681	340 aa		17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	CAV3	P56539	151 aa		17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ISL1	P61371	349 aa		17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf87	Q6PH81	154 aa		17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8N7P7	452 aa		17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR173	Q9NS66	373 aa		17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	RASL12	Q9NYN1	266 aa		17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	17.91	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		17.9	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200		A6NIN4	97 aa		17.9	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF85	Q03923	595 aa		17.9	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		17.9	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	POC1A	Q8NBT0	407 aa		17.9	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		17.9	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	SDSL	Q96GA7	329 aa		17.9	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200		J3QRE1	110 aa		17.89	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNGR1	O43759	233 aa		17.89	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	17.89	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	MELTF	P08582	738 aa		17.89	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PGA5	P0DJD9	388 aa		17.89	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	HAAO	P46952	286 aa		17.89	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDH3A2	P51648	485 aa		17.89	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		17.89	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF573	Q86YE8	665 aa		17.89	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		17.89	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM86B	Q8N661	226 aa		17.89	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	17.89	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF747	Q9BV97	191 aa		17.89	■□□□□ 0.46
PPP4C-205	ENST00000563200	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		17.89	■□□□□ 0.46

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