RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		3.78	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		3.78	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		3.78	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		3.78	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
LINS1-210	ENST00000560934	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TVP23A	A6NH52	213 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SLC1A7	O00341	560 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GPR171	O14626	319 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TNFSF13	O75888	250 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GLCE	O94923	617 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CLPTM1	O96005	669 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CGA	P01215	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	IGHG1	P01857	330 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LYN	P07948	512 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	STS	P08842	583 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	HTR1A	P08908	422 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SBK2	P0C263	348 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	FAM157C	P0CG43	387 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PSKH1	P11801	424 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GNB3	P16520	340 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	AGTR1	P30556	359 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	HTR1F	P30939	366 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	WNT5A	P41221	380 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CA7	P43166	264 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	OR3A2	P47893	321 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CSNK1A1	P48729	337 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	NPY4R	P50391	375 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GNB1	P62873	340 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CSNK2B	P67870	215 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SLC35A2	P78381	396 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ST3GAL4	Q11206	333 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MEP1B	Q16820	701 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	AHSA2	Q719I0	299 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ADCK1	Q86TW2	530 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	OR2T4	Q8NH00	348 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	APH1A	Q96BI3	265 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LGALS12	Q96DT0	336 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF649	Q9BS31	505 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934		Q9H8V8	135 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	WDR76	Q9H967	626 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GLRX2	Q9NS18	164 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	EMC3	Q9P0I2	261 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	FKBP7	Q9Y680	259 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MED12L	Q86YW9	2145 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ATRX	P46100	2492 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	POLE	Q07864	2286 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CENPBD1	B2RD01	187 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934		J3QRE1	110 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CCL21	O00585	134 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SELENOF	O60613	162 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CDK1	P06493	297 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CRH	P06850	196 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC159	P0C7I6	412 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV1-2	P23083	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LAP3	P28838	519 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CRABP1	P29762	137 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ATP6V1E1	P36543	226 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MAP2K4	P45985	399 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	UQCRFS1	P47985	274 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GLIPR1	P48060	266 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	HERV-K104	P61576	105 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	HSF2	Q03933	536 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TMED1	Q13445	227 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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