RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	PGA3	P0DJD8	388 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	NR2C1	P13056	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	PRG2	P13727	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ANOS1	P23352	680 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CNTFR	P26992	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CD200	P41217	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB13	P51153	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	DLX1	P56177	255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ERVK-25	P63136	954 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	FUT5	Q11128	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SYPL1	Q16563	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HIST3H3	Q16695	136 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MICB	Q29980	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF695	Q8IW36	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR5J2	Q8NH18	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC35B4	Q969S0	331 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ATF6B	Q99941	703 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC22A4	Q9H015	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	VNN3	Q9NY84	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CALML5	Q9NZT1	146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1W2PPE2	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1W2PR64	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1W2PRV1	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HMGN4	O00479	90 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	VCY	O14598	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MLNR	O43193	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SPINT2	O43291	252 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	RNF13	O43567	381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	BGLAP	P02818	100 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HLA-DPB1	P04440	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CST2	P09228	141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	GGT2	P36268	569 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MAGEA12	P43365	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	DYNLT3	P51808	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	RAD23A	P54725	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MPPED2	Q15777	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ULK3	Q6PHR2	472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	TEX37	Q96LM6	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	CCL13	Q99616	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	GLS2	Q9UI32	602 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1W2PPH5	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1W2PRG6	482 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		A6NLC8	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686		A8MZ25	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	GMDS	O60547	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-223	ENST00000553686	FCN3	O75636	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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