RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	AHSA2	Q719I0	299 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	C1QL4	Q86Z23	238 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	DTX3	Q8N9I9	347 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SPERT	Q8NA61	448 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SETD9	Q8NE22	299 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	RFK	Q969G6	155 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TECTB	Q96PL2	329 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ALG8	Q9BVK2	526 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SIRPD	Q9H106	197 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	RNF7	Q9UBF6	113 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	KPTN	Q9Y664	436 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		A0A0U1RQK1	487 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	GGT3P	A6NGU5	568 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	LGALS8	O00214	317 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PIN1P1	O15428	100 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MLNR	O43193	412 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MPZL2	O60487	215 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	KRT8	P05787	483 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	FBP1	P09467	338 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	VHL	P40337	213 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SLC15A1	P46059	708 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OR12D2	P58182	307 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MZT1	Q08AG7	82 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ECH1	Q13011	328 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MALL	Q13021	153 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	RIPK1	Q13546	671 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OR8B8	Q15620	311 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SNCB	Q16143	134 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CDON	Q4KMG0	1287 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	FAM201A	Q5SY85	155 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	DRAM2	Q6UX65	266 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		Q6ZTK2	550 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PGAP1	Q75T13	922 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OR5R1	Q8NH85	324 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TFAP2C	Q92754	450 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	LHX4	Q969G2	390 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SGK3	Q96BR1	496 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	REEP6	Q96HR9	211 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	LYZL4	Q96KX0	146 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	C4orf36	Q96KX1	117 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		Q96MT0	163 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MRO	Q9BYG7	248 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	VCX3B	Q9H321	246 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	C8orf4	Q9NR00	106 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	FAM206A	Q9NX38	181 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	OOEP	A6NGQ2	149 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	METTL15	A6NJ78	407 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	SNTN	A6NMZ2	147 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	PTGES3L	E9PB15	166 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688		E9PI62	339 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688		H0YAE9	185 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	SLC1A7	O00341	560 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ADAM20	O43506	726 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	GMDS	O60547	372 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	PEX14	O75381	377 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	OR2T7	P0C7T2	308 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	CA6	P23280	308 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	KIR3DL2	P43630	455 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ETV1	P50549	477 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	LOXL3	P58215	753 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ARF6	P62330	175 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	EGR3	Q06889	387 aa		5.64	□□□□□ -1.51

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