RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 TRGC2P03986 189 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 OR10J4P0C629 311 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 MMP9P14780 707 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 NUBP1P53384 320 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 MEP1BQ16820 701 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 LANCL3Q6ZV70 420 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
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PTPRD-214ENST00000540109 COL4A2P08572 1712 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRD-214ENST00000540109 M0R1X1 148 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRD-214ENST00000540109 B3GALT4O96024 378 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRD-214ENST00000540109 OR7E24Q6IFN5 339 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 LAIR2Q6ISS4 152 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 MFSD12Q6NUT3 480 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRD-214ENST00000540109 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRD-214ENST00000540109 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRD-214ENST00000540109 CA10Q9NS85 328 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 CLDND1Q9NY35 253 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 DOK5Q9P104 306 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PR48 441 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
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PTPRD-214ENST00000540109 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 PLGLB1Q02325 96 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 EGR3Q06889 387 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 DUSP8Q13202 625 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRD-214ENST00000540109 NHLRC3Q5JS37 347 aa5.43□□□□□ -1.54
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