RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 POU3F4P49335 361 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 LCN2P80188 198 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 MERTKQ12866 999 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 HAGHQ16775 308 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 IMPG1Q17R60 797 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 FAM83EQ2M2I3 478 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 HFEQ30201 348 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 VPS26BQ4G0F5 336 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 STEAP4Q687X5 459 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 C3orf33Q6P1S2 294 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CBLN3Q6UW01 205 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TMPPEQ6ZT21 453 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 AAED1Q7RTV5 226 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 MISPQ8IVT2 679 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 WDFY1Q8IWB7 410 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PEX5LQ8IYB4 626 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OR4F15Q8NGB8 312 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF563Q8TA94 476 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PIGXQ8TBF5 258 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GPR119Q8TDV5 335 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PYROXD1Q8WU10 500 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RDH5Q92781 318 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CDS1Q92903 461 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 YIPF5Q969M3 257 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RAB39BQ96DA2 213 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 LRRC39Q96DD0 335 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ARL5BQ96KC2 179 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GPR22Q99680 433 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 DOK1Q99704 481 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 DPH5Q9H2P9 285 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 BEX1Q9HBH7 125 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CRLF2Q9HC73 371 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 POLE3Q9NRF9 147 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ACOXLQ9NUZ1 547 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 IMPAD1Q9NX62 359 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 UBAP1Q9NZ09 502 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 NINJ2Q9NZG7 142 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 FZR1Q9UM11 496 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SNX24Q9Y343 169 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TEX264Q9Y6I9 313 aa2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TGP01266 2768 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF716A6NP11 495 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 G3V4G9 280 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 J3QLI3 93 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 M0R233 179 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF264O43296 627 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SUPT7LO94864 414 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OTCP00480 354 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OPN1MWP04001 364 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OPN1MW2P0DN77 364 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OPN1MW3P0DN78 364 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 HSD17B1P14061 328 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PGAM2P15259 253 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 IVDP26440 423 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CRABP2P29373 138 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SAA4P35542 130 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SLC25A1P53007 311 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RAG2P55895 527 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM33P57088 247 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GMFBP60983 142 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 DR1Q01658 176 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SLC9A3R2Q15599 337 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GSG1Q2KHT4 349 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 VAX1Q5SQQ9 334 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OLFML2AQ68BL7 652 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 NOXRED1Q6NXP6 359 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 NIPAL3Q6P499 406 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OLIG3Q7RTU3 272 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 HMGN2P46Q86SG4 172 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 LRP11Q86VZ4 500 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CEND1Q8N111 149 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 C17orf78Q8N4C9 275 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CDRT4Q8N9R6 151 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ST7LQ8TDW4 575 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RAB1CQ92928 201 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 AMDHD1Q96NU7 426 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZIM3Q96PE6 472 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GAL3ST1Q99999 423 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF416Q9BWM5 594 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms