RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC16A13Q7RTY0 426 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 CA13Q8N1Q1 262 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 BEX2Q9BXY8 128 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM100Q9NV29 134 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 PZPP20742 1482 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 RALGAPBQ86X10 1494 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 SYCP2Q9BX26 1530 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 GLSO94925 669 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 P01737 135 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 RPN2P04844 631 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 SPAM1P38567 509 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS9P46781 194 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 IFITM3Q01628 133 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 INCA1Q0VD86 236 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 ACTL10Q5JWF8 245 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 DEFB132Q7Z7B7 95 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 OR4K5Q8NGD3 323 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 OR1J4Q8NGS1 313 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 GHSRQ92847 366 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 CDS1Q92903 461 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF414Q96IQ9 312 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 MIA2Q96PC5 1412 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 EMC6Q9BV81 110 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 SDHAF2Q9NX18 166 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNRD1Q9P1U0 126 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 PLXNC1O60486 1568 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 RSPH10B2B2RC85 870 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 APCSP02743 223 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 RSPH10BP0C881 870 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 IL12BP29460 328 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 RANBP1P43487 201 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 DNASE1L1P49184 302 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 MTPNP58546 118 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 C6orf99Q4VX62 202 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 SAXO2Q658L1 398 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 OPN5Q6U736 354 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC8AQ8IWT6 810 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFAND1Q8TCF1 268 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 ADTRPQ96IZ2 230 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 RBBP8Q99708 897 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 ACBD6Q9BR61 282 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 COPS4Q9BT78 406 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 C1orf198Q9H425 327 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLPH3Q9H4A6 298 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 HEBP1Q9NRV9 189 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 NECAP2Q9NVZ3 263 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 WIF1Q9Y5W5 379 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM223A0PJW6 202 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 M0R1B8 84 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 BPY2O14599 106 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 ENSAO43768 121 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 APLNRP35414 380 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 P2RY2P41231 377 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 NOVP48745 357 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 PRLHRP49683 370 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 RGS6P49758 472 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 NAB1Q13506 487 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 LGI3Q8N145 548 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF645Q8N7E2 425 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 CYB561A3Q8NBI2 242 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM239Q8WW34 195 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 Q96MT0 163 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 SFXN3Q9BWM7 321 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 ACOT9Q9Y305 439 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 GMEB1Q9Y692 573 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC141Q6ZP82 1450 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 ATRNO75882 1429 aa4.9□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa4.9□□□□□ -1.62
PGGT1B-205ENST00000514178 ERICH2A1L162 156 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-205ENST00000514178 C5orf63A6NC05 138 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-205ENST00000514178 J3QT63 122 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-205ENST00000514178 PSPHP1O15172 72 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-205ENST00000514178 CHST10O43529 356 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXH1O75593 365 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-205ENST00000514178 OR56A5P0C7T3 313 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-205ENST00000514178 PCK1P35558 622 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-205ENST00000514178 ANGPT1Q15389 498 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-205ENST00000514178 PRSS8Q16651 343 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-205ENST00000514178 Q6ZR03 302 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR86Q86TI4 376 aa4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms