RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 CUTCQ9NTM9 273 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 OBP2AQ9NY56 170 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 CEACAM18A8MTB9 384 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM150CB9EJG8 249 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 UMAD1C9J7I0 102 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 H3BMH7 237 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANGPTL7O43827 346 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 CST4P01036 141 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHMP01871 453 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 MT-ND4LP03901 98 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMIM6P0DI80 62 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 ITGA3P26006 1051 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC6A8P48029 635 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXF1Q12946 379 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF561Q8N587 486 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF248Q8NDW4 579 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 THRSPQ92748 146 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 TOMM40LQ969M1 308 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 PIGTQ969N2 578 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR5B2Q96R09 309 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAAP24Q9BTP7 215 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANAPC10Q9UM13 185 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF878C9JN71 531 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 NXPH3O95157 252 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 DBHP09172 617 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 JMJD7P0C870 316 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAHP16930 419 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 CAPZBP47756 277 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 TAS2R31P59538 309 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 KISS1Q15726 138 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 KLHL24Q6TFL4 600 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q7L0L9 218 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRRX2Q99811 253 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 PECRQ9BY49 303 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 VN1R1Q9GZP7 353 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 RGCCQ9H4X1 137 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 SERINC1Q9NRX5 453 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 ABCA7Q8IZY2 2146 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 IFNA2P01563 188 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 CXCL1P09341 107 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOLR1P15328 257 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 CFHR1Q03591 330 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPNS3Q6ZMD2 512 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 NUP54Q7Z3B4 507 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARRDC1Q8N5I2 433 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR1L3Q8NH93 324 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR10A2Q9H208 303 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 F5H5K5 113 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR5AC1P0C628 307 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 FXYD4P59646 89 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 YPEL5P62699 121 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q6ZPA2 131 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRC18Q8N456 261 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC22A8Q8TCC7 542 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 MR1Q95460 341 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF285Q96NJ3 590 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 POLR1DQ9Y2S0 133 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 H7C1Q1 480 aa5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 CHRM2P08172 466 aa5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 DANCRP0C864 163 aa5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNF224P0DH78 156 aa5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 PNLIPP16233 465 aa5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 OMGP23515 440 aa5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYBPHQ13203 477 aa5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 CHRFAM7AQ494W8 412 aa5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 LMX1AQ8TE12 382 aa5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLAMF9Q96A28 289 aa5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR5H15A6NDH6 313 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms