RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 V9GYS6 101 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 K7N7A8 449 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 PSG2P11465 335 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 BRS3P32247 399 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CDC42P60953 191 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ROM1Q03395 351 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 FAM201AQ5SY85 155 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 RRM2BQ7LG56 351 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 OR51A7Q8NH64 312 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 IL17DQ8TAD2 202 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 FUOMA2VDF0 154 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 DLGAP1O14490 977 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 MRASO14807 208 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 PRODHO43272 600 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CSN2P05814 226 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 LMO1P25800 156 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 MAGEA2P43356 314 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 VEGFCP49767 419 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF573Q86YE8 665 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 MKXQ8IYA7 352 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SNX22Q96L94 193 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 VWFP04275 2813 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 HSD17B1P14061 328 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 FMO3P31513 532 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 MAP2K3P46734 347 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CD69Q07108 199 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 PRDX4Q13162 271 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 C4orf46Q504U0 113 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 Q8NFD4 153 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 DCTN6O00399 190 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 IFNGP01579 166 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CX3CR1P49238 355 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 BMXP51813 675 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 KRT72Q14CN4 511 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 MUC7Q8TAX7 377 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CMTM6Q9NX76 183 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SLC1A7O00341 560 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF737O75373 536 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 BRI3O95415 125 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 TK1P04183 234 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 HLA-DPB1P04440 258 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CEACAM3P40198 252 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 FOXE3Q13461 319 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 TIGD4Q8IY51 512 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SLC7A6Q92536 515 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 MYDGFQ969H8 173 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 R3HDM4Q96D70 268 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 SAR1AQ9NR31 198 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 CMC2Q9NRP2 79 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-210ENST00000503258 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.15□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ELANEP08246 267 aa6.15□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF728P0DKX0 622 aa6.15□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 IGLL1P15814 213 aa6.15□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 GPR4P46093 362 aa6.15□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 RAB7AP51149 207 aa6.15□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 LGALS4P56470 323 aa6.15□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 CFHR3Q02985 330 aa6.15□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms