RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717		J3QLW9	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	RHOD	O00212	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	GABRP	O00591	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC22A1	O15245	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PIN1P1	O15428	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	UCHL1	P09936	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	B4GALT1	P15291	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF19	P17023	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF32	P17041	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	CEL	P19835	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TGFBR1	P36897	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PEX19	P40855	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PSG4	Q00888	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	FOXE3	Q13461	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB35	Q15286	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	CDSN	Q15517	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAM1	Q15629	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717		Q8NFD4	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	AKAP9	Q99996	3911 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1W2PPW3	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	C19orf84	I3L1E1	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	AIRE	O43918	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TTR	P02766	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	KRT8	P05787	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TACSTD2	P09758	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PRF1	P14222	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	MMP9	P14780	707 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF823	P16415	610 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SRD5A1	P18405	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PTAFR	P25105	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SSTR2	P30874	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	NCS1	P62166	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	DGCR2	P98153	550 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	FOXI1	Q12951	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TNK1	Q13470	666 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	INSL4	Q14641	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	P2RY6	Q15077	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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