RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.53□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.53□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 HCFC1P51610 2035 aa6.53□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 A0A1W2PPK0 400 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 A6NIN4 97 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PDCD5O14737 125 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SLC22A1O15245 554 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 CST4P01036 141 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV3-13P01766 116 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 HCKP08631 526 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PRKACBP22694 351 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 CA6P23280 308 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MAGEB1P43366 347 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TMBIM6P55061 237 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 NCS1P62166 190 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TLE4Q04727 773 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 OR8G1Q15617 311 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 EFNB3Q15768 340 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 UTS2BQ765I0 119 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 LRP11Q86VZ4 500 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 OR8G5Q8NG78 346 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 OR8S1Q8NH09 359 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PIGCQ92535 297 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SPSB1Q96BD6 273 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ORAI1Q96D31 301 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MICU1Q9BPX6 476 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 CENPOQ9BU64 300 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 BATF3Q9NR55 127 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 GPR173Q9NS66 373 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.52□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 DPPA5A6NC42 116 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 OR5B21A6NL26 309 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 B9A039 149 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 H3BMQ9 156 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PIN1P1O15428 100 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MAGEB3O15480 346 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 CTAG2O75638 210 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 NRASP01111 189 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ATF1P18846 271 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TNFSF4P23510 183 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 BDKRB2P30411 391 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ALDH3B1P43353 468 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SERPINB10P48595 397 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MTNR1BP49286 362 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 EVX1P49640 407 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF81P51508 661 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 VBP1P61758 197 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MZT1Q08AG7 82 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TNK1Q13470 666 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 CTF1Q16619 201 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 CEP78Q5JTW2 689 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 DDI2Q5TDH0 399 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 AGAP6Q5VW22 663 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM42Q69YG0 159 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 USP43Q70EL4 1123 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MOB3CQ70IA8 216 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MUC15Q8N387 334 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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