RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 RGS6P49758 472 aa-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERFP50548 548 aa-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 ART3Q13508 389 aa-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 VPS26BQ4G0F5 336 aa-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 NIPA1Q7RTP0 329 aa-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 IQCKQ8N0W5 287 aa-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 BPIFCQ8NFQ6 507 aa-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4M2Q8NGB6 313 aa-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR10W1Q8NGF6 305 aa-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 TREX1Q9NSU2 369 aa-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM206AQ9NX38 181 aa-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB22AQ9UL26 194 aa-0.08□□□□□ -2.42
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CACNA2D1-211ENST00000486539 BTBD17A6NE02 478 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 SIGLEC16A6NMB1 481 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 NDUFAB1O14561 156 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB29O14966 203 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 PEX11AO75192 247 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 CTAG2O75638 210 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRT14P02533 472 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 PGA4P0DJD7 388 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 PGA3P0DJD8 388 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 PGA5P0DJD9 388 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 USF1P22415 310 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 G6PCP35575 357 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 MT4P47944 62 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP5G2Q06055 141 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC152Q4G0S7 254 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 GCSAMLQ5JQS6 135 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 CFAP157Q5JU67 520 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLEC18BQ6UXF7 455 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZYG11AQ6WRX3 759 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q6ZRU5 148 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q6ZSR6 202 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPATA4Q8NEY3 305 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR8A1Q8NGG7 326 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4K13Q8NH42 304 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUBPLQ8TB37 319 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 TUBGCP3Q96CW5 907 aa-0.09□□□□□ -2.42
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CACNA2D1-211ENST00000486539 SNF8Q96H20 258 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 FANCEQ9HB96 536 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 RGS18Q9NS28 235 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACOT9Q9Y305 439 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-0.09□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABCA4P78363 2273 aa-0.1□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 FRYLO94915 3013 aa-0.1□□□□□ -2.42
CACNA2D1-211ENST00000486539 DLG5Q8TDM6 1919 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 H3BRN7 92 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 CST1P01037 141 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB4AP20338 218 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 MX1P20591 662 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD86P42081 329 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACLYP53396 1101 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 HADHQ16836 314 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 C6orf99Q4VX62 202 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM201AQ5SY85 155 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATAD3BQ5T9A4 648 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 HHATQ5VTY9 493 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM236Q5W0B7 351 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC25A24Q6NUK1 477 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 RUFY3Q7L099 469 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCF23Q7RTU1 214 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM144Q7Z5S9 345 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2M7Q8NG81 312 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR5B3Q8NH48 314 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 SFXN5Q8TD22 340 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM19A4Q96LR4 140 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM165Q9HC07 324 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF160Q9HCG1 818 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 STARD10Q9Y365 291 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 ICOSQ9Y6W8 199 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 VPS13AQ96RL7 3174 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUP205Q92621 2012 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 CADP27708 2225 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 OTOFQ9HC10 1997 aa-0.1□□□□□ -2.43
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
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