RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	CLDN12	P56749	244 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	CDK6	Q00534	326 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	IL5RA	Q01344	420 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	FOXF1	Q12946	379 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	TNK1	Q13470	666 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	MELK	Q14680	651 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	RSU1	Q15404	277 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	APH1B	Q8WW43	257 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	SCN2A	Q99250	2005 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	C20orf202	A1L168	122 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	CLIC1	O00299	241 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	RAB29	O14966	203 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	DLEU1	O43261	78 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	PRAF2	O60831	178 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	ATG12	O94817	140 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	MAK	P20794	623 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	PAX6	P26367	422 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	PSMB6	P28072	239 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	APLNR	P35414	380 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	MGAT2	Q10469	447 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	AIG1	Q9NVV5	245 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM206A	Q9NX38	181 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	CENPF	P49454	3210 aa		4.22	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261		A6NIZ1	184 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261		A8MZ25	164 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261		J3QRK9	145 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261		M0R1B8	84 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	PTTG1	O95997	202 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	MT-ND4	P03905	459 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	ACP2	P11117	423 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	KLK2	P20151	261 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	S100A2	P29034	98 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	LHX2	P50458	406 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	RAP1B	P61224	184 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	RAP1A	P62834	184 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	PSG6	Q00889	435 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261		Q6ZT83	130 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	NRGN	Q92686	78 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	ATP5S	Q99766	215 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	ROS1	P08922	2347 aa		4.21	□□□□□ -1.73
KRIT1-222	ENST00000486261	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		4.21	□□□□□ -1.74
KRIT1-222	ENST00000486261	FCGR3B	O75015	233 aa		4.21	□□□□□ -1.74

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