RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 IL18R1Q13478 541 aa17.43■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 TMEM244Q5VVB8 128 aa17.43■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 C1QL2Q7Z5L3 287 aa17.43■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 RAB40AQ8WXH6 277 aa17.43■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
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ACTB-211ENST00000480301 JAM3Q9BX67 310 aa17.43■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 RASSF4Q9H2L5 321 aa17.43■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 ERVK-18Q9QC07 812 aa17.43■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa17.43■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 PQLC2LA1A4F0 135 aa17.42■□□□□ 0.38
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ACTB-211ENST00000480301 LIMS3P0CW19 117 aa17.42■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 LIMS4P0CW20 117 aa17.42■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 AMY2BP19961 511 aa17.42■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 NPY4RP50391 375 aa17.42■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 GMFBP60983 142 aa17.42■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 TEX29Q8N6K0 151 aa17.42■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 NRG4Q8WWG1 115 aa17.42■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHA1Q9HB21 404 aa17.42■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 SMURF1Q9HCE7 757 aa17.42■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 METRNQ9UJH8 293 aa17.42■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 DOCK11Q5JSL3 2073 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 ATRQ13535 2644 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GW55 424 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD61A6NGH8 418 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 OR4C45A6NMZ5 311 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 C22orf46C9J442 243 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 E9PI62 339 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 FSHBP01225 129 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 ISG15P05161 165 aa17.41■□□□□ 0.38
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ACTB-211ENST00000480301 DUX4L5P0CJ88 424 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 DUX4L6P0CJ89 424 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 DUX4L7P0CJ90 424 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 DCKP27707 260 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 UBE2V2Q15819 145 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 OR5T2Q8NGG2 359 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 ZNF671Q8TAW3 534 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 CCL13Q99616 98 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 SNTG1Q9NSN8 517 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 DUX4Q9UBX2 424 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 AUP1Q9Y679 476 aa17.41■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 TMPRSS2O15393 492 aa17.4■□□□□ 0.38
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ACTB-211ENST00000480301 HAAOP46952 286 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 STUMQ69YW2 141 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 LAIR2Q6ISS4 152 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 ZNF573Q86YE8 665 aa17.4■□□□□ 0.38
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ACTB-211ENST00000480301 C10orf35Q96D05 121 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 TECTBQ96PL2 329 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 MDFIQ99750 246 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 CHST5Q9GZS9 411 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 VCXQ9H320 206 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 DNAJB11Q9UBS4 358 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTB-211ENST00000480301 DVL1O14640 695 aa17.39■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 SYNGR1O43759 233 aa17.39■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 TGM4P49221 684 aa17.39■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ETV1P50549 477 aa17.39■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 BTNL3Q6UXE8 466 aa17.39■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ANGPTL6Q8NI99 470 aa17.39■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 NANPQ8TBE9 248 aa17.39■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
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ACTB-211ENST00000480301 SLC7A11Q9UPY5 501 aa17.39■□□□□ 0.37
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ACTB-211ENST00000480301 J3QT63 122 aa17.38■□□□□ 0.37
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ACTB-211ENST00000480301 CD276Q5ZPR3 534 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ZNF788Q6ZQV5 615 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 CALHM1Q8IU99 346 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 FGFRL1Q8N441 504 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 FAM216BQ8N7L0 139 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ZNF676Q8N7Q3 588 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 POC1AQ8NBT0 407 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 OR51A4Q8NGJ6 313 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 NPRL2Q8WTW4 380 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 FGGYQ96C11 551 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ZNF488Q96MN9 340 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 MRI1Q9BV20 369 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 DNTTIP1Q9H147 329 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 NLKQ9UBE8 527 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 HHLA2Q9UM44 414 aa17.38■□□□□ 0.37
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