RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 METTL11BQ5VVY1 283 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM42Q69YG0 159 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C12orf54Q6X4T0 127 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 Q6ZSR3 168 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CATSPERDQ86XM0 798 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RORBQ92753 470 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDFY2Q96P53 400 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SIRPDQ9H106 197 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNTTIP1Q9H147 329 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 S100A14Q9HCY8 104 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR173Q9NS66 373 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NLKQ9UBE8 527 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM89A2RUT3 159 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A6NIN4 97 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NKX6-3A6NJ46 265 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DLGAP1O14490 977 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCL1P22362 96 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARF6P62330 175 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRRC10Q5BKY1 277 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC25A30Q5SVS4 291 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF788Q6ZQV5 615 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANGPTL6Q8NI99 470 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF671Q8TAW3 534 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AQP3Q92482 292 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNFT2Q96EX2 444 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GAFA1Q96PS6 74 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C9orf16Q9BUW7 83 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNTD2Q9H8S5 307 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACOXLQ9NUZ1 547 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GNG8Q9UK08 70 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A1B0GVI7 797 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR2AT4A6NND4 320 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DHRS7CA6NNS2 312 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 H3BSH0 61 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HAX1O00165 279 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR37O15354 613 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRTN3P24158 256 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HAAOP46952 286 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OCLNQ16625 522 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TP53I3Q53FA7 332 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM220AQ7Z4H9 259 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PQLC1Q8N2U9 271 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRSS35Q8N3Z0 413 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LY6G5BQ8NDX9 201 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMIGD2Q96BF3 282 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC29A1Q99808 456 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AASSQ9UDR5 926 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GMPPBQ9Y5P6 360 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PQLC2LA1A4F0 135 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 J3QRE1 110 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SIGLEC5O15389 551 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYT7O43581 403 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYNGR1O43759 233 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSG2P11465 335 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GABRA2P47869 451 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COMPP49747 757 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BPIFB3P59826 476 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ISL1P61371 349 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL13RA1P78552 427 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDCD1Q15116 288 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DGUOKQ16854 277 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DEFB112Q30KQ8 113 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDONQ4KMG0 1287 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MEDAGQ5VYS4 303 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF573Q86YE8 665 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POC1AQ8NBT0 407 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LHX4Q969G2 390 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MED30Q96HR3 178 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF488Q96MN9 340 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DCTN5Q9BTE1 182 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLEKHA1Q9HB21 404 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ONECUT1Q9UBC0 465 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF222Q9UK12 451 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KPTNQ9Y664 436 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DAPL1A0PJW8 107 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD61A6NGH8 418 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 J3QT63 122 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GABRB1P18505 474 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIR3DL2P43630 455 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACTC1P68032 377 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACTA1P68133 377 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC9A3R2Q15599 337 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACP7Q6ZNF0 438 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VMO1Q7Z5L0 202 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ENTHD1Q8IYW4 607 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms