RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 RHBDL1O75783 438 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ECDO95905 644 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 LIPFP07098 398 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 DUX4L2P0CJ85 424 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 DUX4L3P0CJ86 424 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 DUX4L4P0CJ87 422 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 DUX4L5P0CJ88 424 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 DUX4L6P0CJ89 424 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 DUX4L7P0CJ90 424 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 DBTP11182 482 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 FGF12P61328 243 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF91Q05481 1191 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 C12orf54Q6X4T0 127 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 PRSS35Q8N3Z0 413 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ACBD7Q8N6N7 88 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM216BQ8N7L0 139 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 RHOXF1Q8NHV9 184 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF671Q8TAW3 534 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ST8SIA4Q92187 359 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 AQP3Q92482 292 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 LGALS12Q96DT0 336 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 Q96MT0 163 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 PLEKHA1Q9HB21 404 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 GPR173Q9NS66 373 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 DUX4Q9UBX2 424 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF69Q9UC07 566 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 TRAV40A0A0B4J280 105 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 A6NIN4 97 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 NKX6-3A6NJ46 265 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 AMY2BP19961 511 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 GLRA1P23415 457 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 TGM4P49221 684 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ACTA2P62736 377 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ACTG2P63267 376 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 FDX2Q6P4F2 183 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 BTN2A1Q7KYR7 527 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF573Q86YE8 665 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF555Q8NEP9 628 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 OR5T2Q8NGG2 359 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ANGPTL6Q8NI99 470 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 ADI1Q9BV57 179 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 NLKQ9UBE8 527 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-205ENST00000444916 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 PQLC2LA1A4F0 135 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD61A6NGH8 418 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 OR2AT4A6NND4 320 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF879B4DU55 563 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 H3BSH0 61 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM77I1YAP6 450 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 J3QT63 122 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 GPR37O15354 613 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 NDUFB3O43676 98 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 PLATP00750 562 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 KIR3DL2P43630 455 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 HAAOP46952 286 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 OR12D2P58182 307 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 RCN1Q15293 331 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRC10Q5BKY1 277 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF788Q6ZQV5 615 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 C9orf139Q6ZV77 190 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 FGFRL1Q8N441 504 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 OR2G2Q8NGZ5 317 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 TMIGD2Q96BF3 282 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 C10orf35Q96D05 121 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 GAFA1Q96PS6 74 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 C8orf4Q9NR00 106 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 RASL12Q9NYN1 266 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 SIGLEC5O15389 551 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 GATBO75879 557 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 TOX4O94842 621 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 FADS2O95864 444 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHA1P01876 353 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 SFTPBP07988 381 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 SELLP14151 372 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 MMP9P14780 707 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 MPZP25189 248 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 IL13RA1P78552 427 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB40BQ12829 278 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 IKZF1Q13422 519 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 GALEQ14376 348 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 SMIM21Q3B7S5 101 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms