RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442447.5

RBM39-215, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 644 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-215ENST00000442447 A0A1B0GVI7 797 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 NKX6-3A6NJ46 265 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 NDUFB3O43676 98 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 TOX4O94842 621 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ECDO95905 644 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 MMP9P14780 707 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 CCL1P22362 96 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 GLRA1P23415 457 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 TP53I3Q53FA7 332 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 SLC25A30Q5SVS4 291 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 METTL11BQ5VVY1 283 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 TMEM42Q69YG0 159 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 BRD3OSQ6XYD6 125 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 Q6ZSR3 168 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 C9orf139Q6ZV77 190 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 FAM220AQ7Z4H9 259 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 AQP3Q92482 292 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 WDFY2Q96P53 400 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 TBX15Q96SF7 602 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 SLC29A1Q99808 456 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 NLKQ9UBE8 527 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 GMPPBQ9Y5P6 360 aa13.39□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 DLGAP1O14490 977 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 SYT7O43581 403 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 BAG2O95816 211 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 TGM4P49221 684 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ARF6P62330 175 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 BAMBIQ13145 260 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 OCLNQ16625 522 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 C11orf91Q3C1V1 193 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 LRRC10Q5BKY1 277 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 GPR157Q5UAW9 335 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 MEDAGQ5VYS4 303 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 PRSS35Q8N3Z0 413 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ANGPTL6Q8NI99 470 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ZNF671Q8TAW3 534 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 GAFA1Q96PS6 74 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 SIRPDQ9H106 197 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 DNTTIP1Q9H147 329 aa13.38□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 OR2AT4A6NND4 320 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 DHRS7CA6NNS2 312 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 J3QRE1 110 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 SYNGR1O43759 233 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 HAAOP46952 286 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 GABRA2P47869 451 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ISL1P61371 349 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ACTC1P68032 377 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ACTA1P68133 377 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 IL13RA1P78552 427 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 DGUOKQ16854 277 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 C12orf54Q6X4T0 127 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ZNF788Q6ZQV5 615 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ZNF573Q86YE8 665 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ENTHD1Q8IYW4 607 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 TMIGD2Q96BF3 282 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ZNF488Q96MN9 340 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 CNTD2Q9H8S5 307 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 PLEKHA1Q9HB21 404 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ONECUT1Q9UBC0 465 aa13.37□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 DAPL1A0PJW8 107 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 PQLC2LA1A4F0 135 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ANKRD61A6NGH8 418 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 J3QT63 122 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 SIGLEC5O15389 551 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 PSG2P11465 335 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 GABRB1P18505 474 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 PRTN3P24158 256 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 KIR3DL2P43630 455 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ZNF91Q05481 1191 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 DEFB112Q30KQ8 113 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 RDH10Q8IZV5 341 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 POC1AQ8NBT0 407 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 LY6G5BQ8NDX9 201 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 NPRL2Q8WTW4 380 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 LHX4Q969G2 390 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 MED30Q96HR3 178 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ADI1Q9BV57 179 aa13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa13.35□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa13.35□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 TMEM89A2RUT3 159 aa13.35□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 SNTNA6NMZ2 147 aa13.35□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 HAX1O00165 279 aa13.35□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 GPR37O15354 613 aa13.35□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 SLC16A6O15403 523 aa13.35□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
RBM39-215ENST00000442447 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms