RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 SCGB2A2Q13296 93 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM244Q5VVB8 128 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 CD276Q5ZPR3 534 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 EGFL6Q8IUX8 553 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 AQP3Q92482 292 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 PELI1Q96FA3 418 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF649Q9BS31 505 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 INPP5EQ9NRR6 644 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 SNTG1Q9NSN8 517 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVK13-1Q9NX77 482 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJB11Q9UBS4 358 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 DVL1O14640 695 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF573Q86YE8 665 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 CNIH3Q8TBE1 160 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHA1Q9HB21 404 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 PQLC2LA1A4F0 135 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD61A6NGH8 418 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 EPHA1P21709 976 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 GLRA1P23415 457 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 HAAOP46952 286 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 CCR9P51686 369 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 SYS1Q8N2H4 156 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 SMURF1Q9HCE7 757 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC7A11Q9UPY5 501 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 MXRA5Q9NR99 2828 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 ERICH4A6NGS2 130 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 C22orf46C9J442 243 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 TCF21O43680 179 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 FCN3O75636 299 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 SERPINA3P01011 423 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 FSHBP01225 129 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 ISG15P05161 165 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 AMY2BP19961 511 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2V2Q15819 145 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 STUMQ69YW2 141 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 SETD9Q8NE22 299 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM158Q8WZ71 300 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 C10orf35Q96D05 121 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GW55 424 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF212BA8MTL3 300 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 LIPFP07098 398 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 DUX4L2P0CJ85 424 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 DUX4L3P0CJ86 424 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 DUX4L4P0CJ87 422 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 DUX4L5P0CJ88 424 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 DUX4L6P0CJ89 424 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 DUX4L7P0CJ90 424 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 TGM4P49221 684 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC34A1Q06495 639 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 IL18R1Q13478 541 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 ARMCX4Q5H9R4 360 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 BTN2A1Q7KYR7 527 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 ANGPTL5Q86XS5 388 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 TMIGD2Q96BF3 282 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 FGGYQ96C11 551 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 RASL12Q9NYN1 266 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 NLKQ9UBE8 527 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 DUX4Q9UBX2 424 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4C45A6NMZ5 311 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2AT4A6NND4 320 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 H0YAE9 185 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFB3O43676 98 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 SYNGR1O43759 233 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 ENSAO43768 121 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 ECDO95905 644 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 PPIAL4GP0DN37 164 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 FPR2P25090 351 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 DCKP27707 260 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 CAPGP40121 348 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 FUT6P51993 359 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf91Q3C1V1 193 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM216BQ8N7L0 139 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 ANGPTL6Q8NI99 470 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 ST8SIA4Q92187 359 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 MED30Q96HR3 178 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 JAM3Q9BX67 310 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 DNTTIP1Q9H147 329 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 NUP50Q9UKX7 468 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 ATRQ13535 2644 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-204ENST00000416021 E9PI62 339 aa17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms