RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395878.7

UBFD1-201, Transcript of ubiquitin family domain containing 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene UBFD1, Length 5,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1-201ENST00000395878 SPP1P10451 314 aa15.49■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 FBXO34Q9NWN3 711 aa15.49■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 PRSS23O95084 383 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 GNB2P62879 340 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 PRDX4Q13162 271 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 DHRS2Q13268 280 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 INSL4Q14641 139 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 ZNF766Q5HY98 468 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 THSD4Q6ZMP0 1018 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 Q7L0L9 218 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 TMEM230Q96A57 120 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 PIK3IP1Q96FE7 263 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 GABRG3Q99928 467 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 PLPP3O14495 311 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 PTHLHP12272 177 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 CNN1P51911 297 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 ZNF835Q9Y2P0 537 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 A0A1W2PPQ1 181 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 MASP2O00187 686 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 VMA21Q3ZAQ7 101 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 LRRC10Q5BKY1 277 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 ZNF425Q6IV72 752 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 TAAR3PQ9P1P4 343 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 NDUFB3O43676 98 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 ZP3P21754 424 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 IGFBP7Q16270 282 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 TMEM88Q6PEY1 159 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 MYO7AQ13402 2215 aa15.48■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 M0R1X1 148 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 GPANK1O95872 356 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 NGFP01138 241 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 MDH2P40926 338 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 FZD5Q13467 585 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 PLAC9Q5JTB6 97 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 C17orf47Q8NEP4 570 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 ZFP64Q9NPA5 681 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 PLA2G3Q9NZ20 509 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 CLCF1Q9UBD9 225 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 ZNF320A2RRD8 509 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 ACSM4P0C7M7 580 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 ZNF17P17021 662 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 PPP1R1AQ13522 171 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 SP6Q3SY56 376 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 RNF212Q495C1 297 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 ACER2Q5QJU3 275 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 SFTA3P0C7M3 94 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 ZNF32P17041 273 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 LIMK1P53667 647 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 NXPH1P58417 271 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 ZNF774Q6NX45 483 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 FAM122AQ96E09 287 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 RAB40CQ96S21 281 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 CACNA1CQ13936 2221 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 SPRY3O43610 288 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 COL9A1P20849 921 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 CLRN3Q8NCR9 226 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 OR8D4Q8NGM9 314 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 AKR1E2Q96JD6 320 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 SARGQ9BW04 601 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 RNF24Q9Y225 148 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 F5P12259 2224 aa15.47■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 CDC42EP2O14613 210 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 CDC14BO60729 498 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 CD160O95971 181 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 SEMG1P04279 462 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 CT62P0C5K7 136 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 GUK1Q16774 197 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 UQCC1Q9NVA1 299 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 KRASP01116 189 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 PAX6P26367 422 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 OR2T2Q6IF00 324 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 MRGPREQ86SM8 312 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 MMP26Q9NRE1 261 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 RASL12Q9NYN1 266 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 DBX1A6NMT0 343 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 POU2F2P09086 479 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 SRD5A2P31213 254 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 OR2Z1Q8NG97 314 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 MARVELD1Q9BSK0 173 aa15.46■□□□□ 0.07
UBFD1-201ENST00000395878 DOCK1Q14185 1865 aa15.46■□□□□ 0.06
UBFD1-201ENST00000395878 C9orf170A2RU37 121 aa15.46■□□□□ 0.06
UBFD1-201ENST00000395878 RAB5AP20339 215 aa15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms