RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 LAMTOR5O43504 91 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 GDF9O60383 454 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 NRASP01111 189 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 POU2F2P09086 479 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 LINC00271P0C7V0 271 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF273Q14593 569 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 MIDNQ504T8 468 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 LCN15Q6UWW0 184 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 SYT13Q7L8C5 426 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 MITD1Q8WV92 249 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 MSTNO14793 375 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 NQO2P16083 231 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 EIF1P41567 113 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 SHBQ15464 509 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 AADACL3Q5VUY0 350 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC30A7Q8NEW0 376 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 TTC9Q92623 222 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 NINJ1Q92982 152 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 FANCFQ9NPI8 374 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 LANCL2Q9NS86 450 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 GBF1Q92538 1859 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 CD300LBA8K4G0 201 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 RAMP1O60894 148 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC34A2O95436 690 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 CD37P11049 281 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 PLAURQ03405 335 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 CLCC1Q96S66 551 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 LIPT2A6NK58 231 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF724A8MTY0 619 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 MPTX1A8MV57 137 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 ABCD4O14678 606 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 WDR1O75083 606 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 SRFP11831 508 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM33P57088 247 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 ISXQ2M1V0 245 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 LGI3Q8N145 548 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 PFDN5Q99471 154 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 ZFP57Q9NU63 452 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 MED13LQ71F56 2210 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 C5orf49A4QMS7 147 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 E9PQ18 207 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 H7C1Q1 480 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 GPR37O15354 613 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 SFT2D2O95562 160 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 OR5AC1P0C628 307 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 MST1P26927 711 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 CHATP28329 748 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 HAAOP46952 286 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 RAB11AP62491 216 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 TSC22D1Q15714 1073 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 MPPED2Q15777 294 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF709Q8N972 641 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD42-202ENST00000393389 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms