RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 SSX2Q16385 188 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 AWAT2Q6E213 333 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 CDC20BQ86Y33 519 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC17A5Q9NRA2 495 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 MMP24Q9Y5R2 645 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM166BA8MTA8 275 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 UMAD1C9J7I0 102 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 IL2RAP01589 272 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 FCGR3AP08637 254 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 ALOX5APP20292 161 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 CX3CR1P49238 355 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF529Q6P280 563 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 ZDHHC22Q8N966 263 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 OR2Y1Q8NGV0 311 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC39A7Q92504 469 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 SSX3Q99909 188 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 LANCL2Q9NS86 450 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC16A7O60669 478 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 H2BFMP0C1H6 154 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 ACP1P24666 158 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 PAX6P26367 422 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 MOGAT1Q96PD6 335 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 OPA3Q9H6K4 179 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 PARPBPQ9NWS1 579 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIOO75962 3097 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 CT45A8P0DMV1 189 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 CT45A9P0DMV2 189 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 OR13C7P0DN81 318 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 FGF5P12034 268 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 MSX1P28360 303 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 CT45A2Q5DJT8 189 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 C14orf144Q96I85 54 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 NMES1Q9C002 83 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1B-201ENST00000373433 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 PNPP00491 289 aa9.9□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 GNB3P16520 340 aa9.9□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 NDUFB7P17568 137 aa9.9□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 MIDNQ504T8 468 aa9.9□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 OR11A1Q9GZK7 315 aa9.9□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.9□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.9□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa9.9□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 PRH1P02810 166 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 CLEC9AQ6UXN8 241 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 MDGA2Q7Z553 956 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF679Q8IYX0 411 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRC18Q8N456 261 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 OR13C3Q8NGS6 347 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A087WUJ7 227 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 B4E171 279 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 FTH1P19P0C7X4 201 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC2A1P11166 492 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 TSPAN7P41732 249 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 RIDAP52758 137 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 HMGN3Q15651 99 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 OR2A2Q6IF42 318 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNJ16Q9NPI9 418 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 MYOTQ9UBF9 498 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 B4GALT7Q9UBV7 327 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 TCFL5Q9UL49 500 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 B9D1Q9UPM9 204 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 CCDC168Q8NDH2 2452 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF878C9JN71 531 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 OR2C1O95371 312 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 CYB561P49447 251 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 RSU1Q15404 277 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 GUK1Q16774 197 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 LCN10Q6JVE6 187 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 VHLLQ6RSH7 139 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 BTNL8Q6UX41 500 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF128Q8TEB7 428 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms