RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIP11Q15643 1979 aa1.36□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 JCADQ9P266 1359 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM72A0PK05 275 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 CBR3O75828 277 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTTG1O95997 202 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV1-46P01743 117 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKACAP17612 351 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 HLA-GP17693 338 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFHR2P36980 270 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSKP41240 450 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TGM4P49221 684 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMB2P49721 201 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 HCCSP53701 268 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTPNP58546 118 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKCDQ05655 676 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 SP6Q3SY56 376 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF678Q5SXM1 525 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPTPQ5TA50 214 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBPL2Q6SJ96 375 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM131AQ6UXB0 335 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC35D2Q76EJ3 337 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00469Q8N7U9 141 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR6K6Q8NGW6 343 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 HGDQ93099 445 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 YIPF6Q96EC8 236 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANGPTL4Q9BY76 406 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 C6orf50Q9HD87 102 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFNKQ9P0W0 207 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 HMGXB4Q9UGU5 601 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 THADAQ6YHU6 1953 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 J3QT63 122 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLEKHA8P1O95397 391 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ETHE1O95571 254 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 NRASP01111 189 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 HRASP01112 189 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRASP01116 189 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGKV1-39P01597 117 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGKV1D-39P04432 117 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRMP19623 302 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 RGS6P49758 472 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC35B1P78383 322 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP5G2Q06055 141 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ST3GAL4Q11206 333 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDNFQ49AH0 187 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM104BQ5XKR9 115 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 BRD3OSQ6XYD6 125 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC8AQ8IWT6 810 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO36Q8NEA4 188 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFAND1Q8TCF1 268 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 MS4A8Q9BY19 250 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 LZTFL1Q9NQ48 299 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 CA10Q9NS85 328 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF391Q9UJN7 358 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 KPTNQ9Y664 436 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC22A7Q9Y694 548 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CACNA1DQ01668 2161 aa1.34□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SBNO1A3KN83 1393 aa1.34□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa1.34□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC100653049A0A140TA62 436 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 H7C2Y5 167 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT34O76011 436 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PFN1P07737 140 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD9P21926 228 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAX6P26367 422 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 IVDP26440 423 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 HLA-DMAP28067 261 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD34P28906 385 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNRHRP30968 328 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MLF1P58340 268 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAS2R60P59551 318 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMC5P62195 406 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PMVKQ15126 192 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP6V1FQ16864 119 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFAND6Q6FIF0 208 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF321PQ8N8H1 164 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2M7Q8NG81 312 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ORAOV1Q8WV07 137 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM131CQ96AQ9 280 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms