RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP6V0D1P61421 351 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB11AP62491 216 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC9A3R2Q15599 337 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB11BQ15907 218 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF141Q15928 474 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPRG1LQ5T0D9 272 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPTPQ5TA50 214 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 HHATQ5VTY9 493 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM104BQ5XKR9 115 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 OTUD6AQ7L8S5 288 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 DAW1Q8N136 415 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAM1L1Q8N609 369 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q8NDZ9 215 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ISOC2Q96AB3 205 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBE2E2Q96LR5 201 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2V2Q96R30 315 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM175Q9BSA9 504 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCG5Q9H222 651 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 FANCEQ9HB96 536 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS16Q9NQE7 514 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO8Q9NRD0 319 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 CES1P1Q9UKY3 287 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX19BQ9UMR2 479 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GTQ1 180 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM72A0PK05 275 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDHAF1A6NFY7 115 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 HACD1B0YJ81 288 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 H0YIV9 168 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 C3orf84H3BNL1 204 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 C15orf65H3BRN8 121 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 CASC3O15234 703 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 AQP9O43315 295 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRASP01111 189 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 HRASP01112 189 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRASP01116 189 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV1-39P01597 117 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV1D-39P04432 117 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 STAG3L3P0CL85 134 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 SFTPCP11686 197 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL3RAP26951 378 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 GABRR2P28476 465 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPAG1Q07617 926 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRDNQ13061 729 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAPRE2Q15555 327 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF470Q6ECI4 717 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ULK3Q6PHR2 472 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNPY4Q8N129 248 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 PROKR2Q8NFJ6 384 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACTL9Q8TC94 416 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARV1Q9H2C2 271 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR51B5Q9H339 312 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 INIPQ9NRY2 104 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 CA10Q9NS85 328 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADA2Q9NZK5 511 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 VAX2Q9UIW0 290 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB22AQ9UL26 194 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR19Q8NEZ3 1342 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0G2JMP0 313 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0X1KG70 313 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 IZUMO1RA6ND01 250 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 AKR7A2O43488 359 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNK2O95069 426 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHG2P01859 326 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLK1P06870 262 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC35G6P0C7Q6 338 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 RALBP11234 206 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMCHP20382 165 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARL2P36404 184 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR12D2P58182 307 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTPNP58546 118 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 DAOAP59103 153 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2orf54Q08AI8 447 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADIGQ0VDE8 80 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSC22D1Q15714 1073 aa1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms