RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 TTC23Q5W5X9 447 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 STUMQ69YW2 141 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FDX2Q6P4F2 183 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DHRSXQ8N5I4 330 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OR5T2Q8NGG2 359 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OR10AC1Q8NH08 325 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 AQP3Q92482 292 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 CCL13Q99616 98 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ADI1Q9BV57 179 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ERVK13-1Q9NX77 482 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ERVK-18Q9QC07 812 aa12.41□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PQLC2LA1A4F0 135 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD61A6NGH8 418 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFA2O43678 99 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SYNGR1O43759 233 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FADS2O95864 444 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 GNAO1P09471 354 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 SELLP14151 372 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PAX8Q06710 450 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 MICBQ29980 383 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 FAM216BQ8N7L0 139 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 NPRL2Q8WTW4 380 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 RAB40AQ8WXH6 277 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF488Q96MN9 340 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DCLRE1BQ9H816 532 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHA1Q9HB21 404 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 KAAG1Q9UBP8 84 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 METRNQ9UJH8 293 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 AUP1Q9Y679 476 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 DOCK11Q5JSL3 2073 aa12.4□□□□□ -0.42
CSAG1-201ENST00000361211 OR4C45A6NMZ5 311 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 E9PI62 339 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 DVL1O14640 695 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TMPRSS2O15393 492 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 LIMS3P0CW19 117 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 LIMS4P0CW20 117 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 EPHA1P21709 976 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 GLRA1P23415 457 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CAPGP40121 348 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 HAAOP46952 286 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NPY4RP50391 375 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2V2Q15819 145 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 KLHL22Q53GT1 634 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM244Q5VVB8 128 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 BATF2Q8N1L9 274 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SYS1Q8N2H4 156 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 OR51A4Q8NGJ6 313 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NANPQ8TBE9 248 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NRG4Q8WWG1 115 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CHST5Q9GZS9 411 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 INPP5EQ9NRR6 644 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NLKQ9UBE8 527 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJB11Q9UBS4 358 aa12.39□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 J3QT63 122 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ETV1P50549 477 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CCR9P51686 369 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SLC34A1Q06495 639 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 LAIR2Q6ISS4 152 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 BTNL3Q6UXE8 466 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CALHM1Q8IU99 346 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TEX29Q8N6K0 151 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SETD9Q8NE22 299 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC54Q8NEL0 328 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ANGPTL6Q8NI99 470 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ST8SIA4Q92187 359 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 GAFA1Q96PS6 74 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 MRI1Q9BV20 369 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 JAM3Q9BX67 310 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 OCEL1Q9H607 264 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 H0YAE9 185 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ENSAO43768 121 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ISG15P05161 165 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PGA5P0DJD9 388 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 IKZF1Q13422 519 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 IL18R1Q13478 541 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ARMCX4Q5H9R4 360 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 XAF1Q6GPH4 301 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ANGPTL5Q86XS5 388 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF573Q86YE8 665 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 POC1AQ8NBT0 407 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF671Q8TAW3 534 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 C22orf15Q8WYQ4 148 aa12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms