RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 SNTG1Q9NSN8 517 aa22.45■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 CLN8Q9UBY8 286 aa22.45■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD61A6NGH8 418 aa22.44■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 IFNA2P01563 188 aa22.44■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 HTR1AP08908 422 aa22.44■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 GATA3P23771 443 aa22.44■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 SYS1Q8N2H4 156 aa22.44■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 NPRL2Q8WTW4 380 aa22.44■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 AQP3Q92482 292 aa22.44■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 TECTBQ96PL2 329 aa22.44■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 CCL13Q99616 98 aa22.44■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHA1Q9HB21 404 aa22.44■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 INPP5EQ9NRR6 644 aa22.44■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 PQLC2LA1A4F0 135 aa22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 OR4C45A6NMZ5 311 aa22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 SYNGR1O43759 233 aa22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 CPT2P23786 658 aa22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 UBE2V2Q15819 145 aa22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 KCNJ8Q15842 424 aa22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 C1QL2Q7Z5L3 287 aa22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 FAM216BQ8N7L0 139 aa22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 SETD9Q8NE22 299 aa22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 OR51A4Q8NGJ6 313 aa22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF488Q96MN9 340 aa22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 MDFIQ99750 246 aa22.43■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 H0YAE9 185 aa22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 FSHBP01225 129 aa22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 SELLP14151 372 aa22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 ETV1P50549 477 aa22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 IL18R1Q13478 541 aa22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 MICBQ29980 383 aa22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL22Q53GT1 634 aa22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 STUMQ69YW2 141 aa22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 JAM3Q9BX67 310 aa22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 CHST5Q9GZS9 411 aa22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM36Q9NQ86 728 aa22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 ERVK-18Q9QC07 812 aa22.42■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 TMPRSS2O15393 492 aa22.41■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 HAAOP46952 286 aa22.41■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 CCR9P51686 369 aa22.41■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 OR2G6Q5TZ20 316 aa22.41■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 XAF1Q6GPH4 301 aa22.41■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 BATF2Q8N1L9 274 aa22.41■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 RAB40AQ8WXH6 277 aa22.41■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 DVL1O14640 695 aa22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFA2O43678 99 aa22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 ISG15P05161 165 aa22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 PAX8Q06710 450 aa22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM244Q5VVB8 128 aa22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 ANGPTL5Q86XS5 388 aa22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 CALHM1Q8IU99 346 aa22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 FBLIM1Q8WUP2 373 aa22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 TFAP2CQ92754 450 aa22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 KAAG1Q9UBP8 84 aa22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJB11Q9UBS4 358 aa22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 AUP1Q9Y679 476 aa22.4■■□□□ 1.18
TPGS1-201ENST00000359315 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa22.39■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa22.39■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 J3QT63 122 aa22.39■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 GLRA1P23415 457 aa22.39■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 AQP4P55087 323 aa22.39■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 CLEC2DQ9UHP7 191 aa22.39■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa22.39■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 XPNPEP2O43895 674 aa22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 ZFPL1O95159 310 aa22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 EPHA1P21709 976 aa22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 POC1AQ8NBT0 407 aa22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC54Q8NEL0 328 aa22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 GGHQ92820 318 aa22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 FGGYQ96C11 551 aa22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 GAFA1Q96PS6 74 aa22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 VCXQ9H320 206 aa22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 NLKQ9UBE8 527 aa22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 METRNQ9UJH8 293 aa22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa22.37■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 DCKP27707 260 aa22.37■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 NPY4RP50391 375 aa22.37■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 IKZF1Q13422 519 aa22.37■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 BTNL3Q6UXE8 466 aa22.37■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF573Q86YE8 665 aa22.37■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF676Q8N7Q3 588 aa22.37■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 ANGPTL6Q8NI99 470 aa22.37■■□□□ 1.17
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF671Q8TAW3 534 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms