RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355560.4

CLK2-201, Transcript of CDC like kinase 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CLK2, Length 2,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2-201ENST00000355560 OPA3Q9H6K4 179 aa22.16■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 ING3Q9NXR8 418 aa22.16■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 PRAF2O60831 178 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 CSTBP04080 98 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 CELA3BP08861 270 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 FCN2Q15485 313 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 A0A1B0GUH1 482 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 HTR3BO95264 441 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 AMY2AP04746 511 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.142e-8■■■■■ 51.2
CLK2-201ENST00000355560 OR52W1Q6IF63 320 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 CRIM1Q9NZV1 1036 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK2-201ENST00000355560 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 PRDX4Q13162 271 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 FAM180AQ6UWF9 173 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 TCTE3Q8IZS6 198 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 FTMTQ8N4E7 242 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 WBP1Q96G27 269 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 K7ENP7 123 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 HOXC12P31275 282 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 RAD52P43351 418 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 RTL6Q6ICC9 239 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 Q96M66 194 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 PROCRQ9UNN8 238 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 ATMQ13315 3056 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 HPXP02790 462 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 GABRR1P24046 479 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 PDZK1IP1Q13113 114 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 CD276Q5ZPR3 534 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 ASCL4Q6XD76 172 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 BHLHE23Q8NDY6 225 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 OR5L1Q8NGL2 311 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 EXTL1Q92935 676 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 STARD4Q96DR4 205 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 TOXO94900 526 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 IGKV1D-12P01611 117 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 MECP2P51608 486 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 METTL11BQ5VVY1 283 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 IDO2Q6ZQW0 420 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 CD163Q86VB7 1156 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 BPIFB2Q8N4F0 458 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 OR11H7Q8NGC8 314 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 FAM215AQ9Y5M1 114 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 FIGNL2A6NMB9 653 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 CD300LBA8K4G0 201 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 SSNA1O43805 119 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 WDR1O75083 606 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 CST4P01036 141 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 CSN2P05814 226 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 ARFRP1Q13795 201 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 MEF2DQ14814 521 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 KCNJ8Q15842 424 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 TBR1Q16650 682 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 CALHM1Q8IU99 346 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 PXT1Q8NFP0 134 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 SEC22CQ9BRL7 303 aa22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 RLN1P04808 185 aa22.11■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 ZNF735P0CB33 412 aa22.11■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 MAB21L1Q13394 359 aa22.11■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 NKPD1Q17RQ9 610 aa22.11■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 ZNF610Q8N9Z0 462 aa22.11■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 HPSE2Q8WWQ2 592 aa22.11■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 PECRQ9BY49 303 aa22.11■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 RRP8O43159 456 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 CGAP01215 116 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 KRTCAP3Q53RY4 240 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 SPATA46Q5T0L3 261 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 RPRMLQ8N4K4 120 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 ZNF611Q8N823 705 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 SLC6A7Q99884 636 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 CDH20Q9HBT6 801 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 HRH1P35367 487 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 OR51F2Q8NH61 342 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 ST8SIA4Q92187 359 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 SNAPC3Q92966 411 aa22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CLK2-201ENST00000355560 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.2 ms