RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 SHDQ96IW2 340 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 C2orf50Q96LR7 162 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 S100A13Q99584 98 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 PIGQQ9BRB3 760 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 NELFAQ9H3P2 528 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM100Q9NV29 134 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 V9GYS6 101 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 A0A0G2JMM0 328 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PPB8 328 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PRS3 328 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 C9JQL5 133 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 K7ESF4 209 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 M0R135 149 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 IGLV3-1P01715 115 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM225BP0DP42 221 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 HKR1P10072 659 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 NAT2P11245 290 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF708P17019 499 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 THBS4P35443 961 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 TAF9Q16594 264 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 HFEQ30201 348 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 UQCC3Q6UW78 93 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM54Q969K7 222 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 TOMM40LQ969M1 308 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF799Q96GE5 643 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 AQP10Q96PS8 301 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 IER2Q9BTL4 223 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 PROK2Q9HC23 129 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 A0A0J9YW62 118 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 DHHO43323 396 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 ZIC3O60481 467 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 IFNA2P01563 188 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 UMODP07911 640 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 LYL1P12980 280 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 CCL4P13236 92 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 PRKACAP17612 351 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 IL32P24001 234 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 NTF4P34130 210 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 AKR1C3P42330 323 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 MTCP1P56278 107 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 TAS2R46P59540 309 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 FXYD4P59646 89 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 IL15RAQ13261 267 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF774Q6NX45 483 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM123Q8N131 208 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 ZFP82Q8N141 532 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 SVBPQ8N300 66 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 GJC3Q8NFK1 279 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 HAS2Q92819 552 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 ERGIC1Q969X5 290 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 SGK3Q96BR1 496 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 CHST5Q9GZS9 411 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 RHOFQ9HBH0 211 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 MMP26Q9NRE1 261 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 FBXL17Q9UF56 701 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-202ENST00000342084 AK3Q9UIJ7 227 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms