RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340958.3

CLDN4-201, Transcript of claudin 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN4, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4-201ENST00000340958 MPIG6BO95866 241 aa14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 PPP3CBP16298 524 aa14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CA6P23280 308 aa14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 GPM6AP51674 278 aa14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 RSU1Q15404 277 aa14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 POC5Q8NA72 575 aa14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 RNF170Q96K19 258 aa14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 METTL9Q9H1A3 318 aa14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 FZR1Q9UM11 496 aa14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 ATP6V1G1O75348 118 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CSF3P09919 207 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 SERPINA2P20848 420 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 MPV17P39210 176 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 TAS2R20P59543 309 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 MTFR2Q6P444 385 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 VHLLQ6RSH7 139 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 ACBD4Q8NC06 268 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 BANF2Q9H503 90 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 NGBQ9NPG2 151 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 A0A1W2PQ09 198 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF732B4DXR9 585 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 LDLRAD4O15165 306 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 KDM4BO94953 1096 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CD40P25942 277 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 MNDAP41218 407 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 PSG7Q13046 419 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 FAM189A2Q15884 450 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 OR5A2Q8NGI9 324 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.87□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.86□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.86□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 ANGPTL7O43827 346 aa14.86□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CDC14BO60729 498 aa14.86□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 MMP15P51511 669 aa14.86□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 UNC119Q13432 240 aa14.86□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.86□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CHST4Q8NCG5 386 aa14.86□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.86□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.86□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 DUSP13Q9UII6 198 aa14.86□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 LILRA1O75019 489 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 SCGNO76038 276 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 HTR3BO95264 441 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CYB5AP00167 134 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 PTAFRP25105 342 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 HAAOP46952 286 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 QRFPP83859 136 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 GPR176Q14439 515 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 RAB12Q6IQ22 244 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 OR5P3Q8WZ94 311 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 MICU1Q9BPX6 476 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 TMEM100Q9NV29 134 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 PTPN13Q12923 2485 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 A0A0A6YYH2 397 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 A6NJ64 397 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 RNF224P0DH78 156 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 NAT2P11245 290 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 VEGFCP49767 419 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 ZP1P60852 638 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 OR8G1Q15617 311 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 C4orf17Q53FE4 359 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 SLC22A25Q6T423 547 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 TMEM104Q8NE00 496 aa14.85□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 OR51F2Q8NH61 342 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms