RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 OR2AT4A6NND4 320 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 F8VVB4 439 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 F8VWA3 439 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CYTIPO60759 359 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 TMEM127O75204 238 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 RBBP9O75884 186 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 FAM87AP0C7U9 286 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 FAM157CP0CG43 387 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 NR2C1P13056 603 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 SLC16A1P53985 500 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 SLC17A1Q14916 467 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CDK5R1Q15078 307 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 TAF13Q15543 124 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 SSX2Q16385 188 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 REC114Q7Z4M0 266 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 ZNF383Q8NA42 475 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 SLAMF9Q96A28 289 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 UCN2Q96RP3 112 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 NEU1Q99519 415 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 NOX4Q9NPH5 578 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 HAO2Q9NYQ3 351 aa8.94□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 ZNF879B4DU55 563 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 OR4E1P0C645 316 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 SLC2A5P22732 501 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CPT2P23786 658 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 POU3F4P49335 361 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 RBP2P50120 134 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 BIDP55957 195 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 POU4F2Q12837 409 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 LIPNQ5VXI9 398 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 EXD3Q8N9H8 876 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 PIK3IP1Q96FE7 263 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 POFUT1Q9H488 388 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CACNA1BQ00975 2339 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 RAMP1O60894 148 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 GLCEO94923 617 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 IGHG1P01857 330 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 MELTFP08582 738 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CSF1P09603 554 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 SFTA3P0C7M3 94 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CALCBP10092 127 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 ACKR3P25106 362 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CRABP1P29762 137 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 RAB5CP51148 216 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CAV2P51636 162 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CLDN17P56750 224 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 OR10K2Q6IF99 312 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 RHOUQ7L0Q8 258 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 ZPLD1Q8TCW7 415 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 PHYHIPQ92561 330 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 RAB3CQ96E17 227 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 PELI1Q96FA3 418 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 KCNK17Q96T54 332 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 MRI1Q9BV20 369 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 TUBA4BQ9H853 241 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 RHOFQ9HBH0 211 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 MED29Q9NX70 200 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 COMMD9Q9P000 198 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CENPEQ02224 2701 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 A6NLC8 198 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 ZNF716A6NP11 495 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CD1AP06126 327 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 CD2P06729 351 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
GINS3-201ENST00000318129 FCGR2AP12318 317 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.9 ms