RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 WNT5AP41221 380 aa23.15■■□□□ 1.3
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HOXD8-201ENST00000313173 Q96M66 194 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 MGAQ8IWI9 3026 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF850A8MQ14 1090 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 TBPP20226 339 aa23.14■■□□□ 1.3
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HOXD8-201ENST00000313173 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXD8-201ENST00000313173 SEC22CQ9BRL7 303 aa23.14■■□□□ 1.3
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HOXD8-201ENST00000313173 MKRN2OSH3BPM6 223 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 C1QBP02746 253 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 ID4P47928 161 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 ARL6IP1Q15041 203 aa23.14■■□□□ 1.29
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HOXD8-201ENST00000313173 PXT1Q8NFP0 134 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
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HOXD8-201ENST00000313173 RLN1P04808 185 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 NAT1P18440 290 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 COX5AP20674 150 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 CBX5P45973 191 aa23.12■■□□□ 1.29
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HOXD8-201ENST00000313173 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
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HOXD8-201ENST00000313173 FTMTQ8N4E7 242 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 OR5L1Q8NGL2 311 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 PRRT1Q99946 306 aa23.12■■□□□ 1.29
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HOXD8-201ENST00000313173 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINE3A8MV23 424 aa23.11■■□□□ 1.29
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HOXD8-201ENST00000313173 FOXF2Q12947 444 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 ARFRP1Q13795 201 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 BOD1Q96IK1 185 aa23.11■■□□□ 1.29
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HOXD8-201ENST00000313173 J3QW42 95 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 RRP8O43159 456 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV1D-12P01611 117 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 GZMKP49863 264 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 SNAPC3Q92966 411 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 CRIM1Q9NZV1 1036 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 MEIKINA0A087WXM9 373 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 PQLC2LA1A4F0 135 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 CD300LBA8K4G0 201 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 S100A1P23297 94 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 ERP29P30040 261 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXD8-201ENST00000313173 HRH1P35367 487 aa23.1■■□□□ 1.29
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