RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 ASB1Q9Y576 335 aa6.46□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ZNF785A8K8V0 405 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 C21orf140B9A014 251 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CDC14BO60729 498 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CCR2P41597 374 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 HTRA3P83110 453 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 HFEQ30201 348 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 LCN15Q6UWW0 184 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 Q7L0L9 218 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 MOB3BQ86TA1 216 aa6.45□□□□□ -1.38
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CPS1-201ENST00000233072 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 NPAS1Q99742 590 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 VAMP8Q9BV40 100 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 H0Y8G0 127 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TNFSF14O43557 240 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CST2P09228 141 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 SFTPCP11686 197 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 PTHLHP12272 177 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 P2RX3P56373 397 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 PRDX4Q13162 271 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 Q56UQ5 140 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OR4C3Q8NH37 302 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OR6X1Q8NH79 312 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OR1L3Q8NH93 324 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 PATE1Q8WXA2 126 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TMEM210A6NLX4 147 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 K7EQS6 105 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 PEX11BO96011 259 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 AANATQ16613 207 aa6.45□□□□□ -1.38
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CPS1-201ENST00000233072 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 COX14Q96I36 57 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 FOXQ1Q9C009 403 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 NAA60Q9H7X0 242 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 PLPP3O14495 311 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 B4GALT3O60512 393 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 SP1P08047 785 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 RPEL1Q2QD12 228 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TMED6Q8WW62 240 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TXNDC12O95881 172 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A4P12235 298 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 GUK1Q16774 197 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 FA2HQ7L5A8 372 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TMEM123Q8N131 208 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 UBE2FQ969M7 185 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 RPEQ96AT9 228 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TM4SF19Q96DZ7 209 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.45□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 EPPINO95925 133 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 NGFP01138 241 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 PNLIPP16233 465 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 FAHP16930 419 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TMEM11P17152 192 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 EPHA2P29317 976 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CD81P60033 236 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OOEPA6NGQ2 149 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 M0R1X1 148 aa6.44□□□□□ -1.38
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