RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CITED4Q96RK1 184 aa13.15□□□□□ -0.3
SPCS1-201ENST00000233025 ATF6BQ99941 703 aa13.15□□□□□ -0.3
SPCS1-201ENST00000233025 Q9H521 79 aa13.15□□□□□ -0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
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SPCS1-201ENST00000233025 RENP00797 406 aa13.14□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 RAB13P51153 203 aa13.14□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 ECH1Q13011 328 aa13.14□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 KRT77Q7Z794 578 aa13.14□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 OR5D13Q8NGL4 314 aa13.14□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 IFT27Q9BW83 186 aa13.14□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 PLA1AQ53H76 456 aa13.13□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 STUMQ69YW2 141 aa13.13□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 BHLHE40O14503 412 aa13.12□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 ST8SIA5O15466 376 aa13.12□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 SNAI3Q3KNW1 292 aa13.12□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa13.12□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 C10orf99Q6UWK7 81 aa13.12□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 SBSPONQ8IVN8 264 aa13.12□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 C11orf53Q8IXP5 236 aa13.12□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 LRRC29Q8WV35 223 aa13.12□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa13.11□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa13.11□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 OR51D1Q8NGF3 324 aa13.1□□□□□ -0.31
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SPCS1-201ENST00000233025 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 RAB26Q9ULW5 256 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS1-201ENST00000233025 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa13.1□□□□□ -0.31
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