RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 CADM3Q8N126 398 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 SLC26A10Q8NG04 563 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 TSLPQ969D9 159 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 TREM2Q9NZC2 230 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 CLEC1BQ9P126 229 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 CDS2O95674 445 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 SLC25A53Q5H9E4 307 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 AUNIPQ9H7T9 357 aa5.64□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 BET1O15155 118 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 FADS1O60427 444 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 HLA-DQB1P01920 261 aa5.64□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 C4orf17Q53FE4 359 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 LRRC10Q5BKY1 277 aa5.64□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 BAP18Q8IXM2 172 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 SLC30A7Q8NEW0 376 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 OR4A4PQ8NGN8 299 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 YIPF5Q969M3 257 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 OR5H8P0DN80 308 aa5.63□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 MADCAM1Q13477 382 aa5.63□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 HGDQ93099 445 aa5.63□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.63□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.63□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.63□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 RASL12Q9NYN1 266 aa5.63□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 A0A0A6YYJ9 748 aa5.63□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa5.63□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa5.63□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 S100A8P05109 93 aa5.63□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 LINC00696Q6ZRV3 163 aa5.63□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.63□□□□□ -1.51
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