RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 TNCP24821 2201 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 CREBBPQ92793 2442 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 DSCAMO60469 2012 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 AQP7O14520 342 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 RAF1P04049 648 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 GTF2F2P13984 249 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 BTCP35070 178 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PTGFRP43088 359 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ARFRP1Q13795 201 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 BCL2A1Q16548 175 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TATDN3Q17R31 274 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF181Q2M3W8 571 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ATAD3CQ5T2N8 411 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 OR51T1Q8NGJ9 327 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PROCRQ9UNN8 238 aa5.66□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 WNT9BO14905 357 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV3-13P01766 116 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV3-7P01780 117 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 RLN1P04808 185 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 MGMTP16455 207 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 CALCRP30988 508 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 DEFA1P59665 94 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 DEFA3P59666 94 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 FAM166AQ6J272 317 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 Q6ZT83 130 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PRR18Q8N4B5 295 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 OR51S1Q8NGJ8 323 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 OR51F2Q8NH61 342 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PRR7Q8TB68 274 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 HPSE2Q8WWQ2 592 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 WBP1Q96G27 269 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 S100A13Q99584 98 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 SEC22CQ9BRL7 303 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 FAIMQ9NVQ4 179 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 DCAF16Q9NXF7 216 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 CD300LBA8K4G0 201 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF724A8MTY0 619 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF732B4DXR9 585 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 LINC01387J3KSC0 135 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 CDIPTO14735 213 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 UBL3O95164 117 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 HPXP02790 462 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 NR2C1P13056 603 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF12P17014 697 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 HIST1H3AP68431 136 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PSG7Q13046 419 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 IGFL3Q6UXB1 125 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 HIST2H3AQ71DI3 136 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF611Q8N823 705 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 WDR31Q8NA23 367 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 LINC01560Q8TB33 94 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 RDH5Q92781 318 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 LPAR5Q9H1C0 372 aa5.65□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PRRG2O14669 202 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 HS3ST1O14792 307 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 PMP2P02689 132 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 GALP22466 123 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 PRDX4Q13162 271 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 PYHIN1Q6K0P9 492 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ADAM5Q6NVV9 412 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 LYPD6Q86Y78 171 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 OR6M1Q8NGM8 313 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM45BQ96B21 275 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 CHIAQ9BZP6 476 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 PLSCR2Q9NRY7 297 aa5.65□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 FIGNL2A6NMB9 653 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 F5H5P2 479 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 SIX6O95475 246 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 SERPINA5P05154 406 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 HOXC12P31275 282 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 TMPRSS3P57727 454 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 OR52H1Q8NGJ2 320 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 OR4C16Q8NGL9 310 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 CACNG2Q9Y698 323 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 OR6C65A6NJZ3 312 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 PRSS3P35030 304 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 TGFBR3Q03167 851 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 FCAMRQ8WWV6 532 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 SORCS2Q96PQ0 1159 aa5.64□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 CHST5Q9GZS9 411 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms