RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 JPT1P97825 154 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf133Q14B02 382 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Esp1Q3LHH8 102 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Thsd4Q3UTY6 1018 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akt2Q60823 481 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hist2h2abQ64522 130 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc22a18Q78KK3 406 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1216Q7TR05 311 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1148Q7TR35 314 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Colec10Q8CF98 277 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Esco2Q8CIB9 592 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nsun5Q8K4F6 465 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r35Q8R2E2 296 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sav1Q8VEB2 386 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr732Q8VFT5 308 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1389Q8VGX0 311 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cacng5Q8VHW4 275 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc27a4Q91VE0 643 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Asb10Q91ZT7 467 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Letmd1Q924L1 360 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubqln4Q99NB8 596 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf138Q9CQE0 245 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HikeshiQ9DD02 197 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Srsf10Q9R0U0 262 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psma1Q9R1P4 263 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hebp2Q9WU63 205 aa5.9□□□□□ -1.46
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cabin1G3X8Q1 2187 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm11756A2BEJ1 356 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr747E9PXH6 313 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr749E9Q438 313 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r7E9Q8T0 311 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp988F6VKC7 633 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21761J3QK00 171 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r103K7N6X7 305 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r151L7N288 305 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tcstv3O70518 169 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ikzf2P81183 526 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim63Q38HM4 350 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fndc4Q3TR08 231 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mansc4Q3UU94 337 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TrmoQ562D6 431 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Selenbp2Q63836 472 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mapk3Q63844 380 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mc2rQ64326 296 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glt8d1Q6NSU3 371 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1173Q7TR24 312 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr92Q8BGF3 357 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc35d3Q8BGF8 422 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif1axQ8BMJ3 144 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LmlnQ8BMN4 681 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CebpzosQ8BTE5 80 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acot4Q8BWN8 421 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam120cQ8C3F2 1091 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc16a13Q8CE94 428 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GnalQ8CGK7 381 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r229Q8R2A9 306 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r37Q8R2E4 302 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr995Q8VF74 315 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr788Q8VFI0 311 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinb1bQ8VHP7 382 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ms4a8Q99N10 290 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 D10Wsu102eQ9CX66 185 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SdhdQ9CXV1 159 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 9230104L09RikQ9D264 133 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpx8Q9D7B7 209 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AspdhQ9DCQ2 287 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stard5Q9EPQ7 213 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klrc3Q9QXN7 221 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Syt9Q9R0N9 491 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klf5Q9Z0Z7 446 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc166S4R181 449 aa5.9□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ly6g6fB2RXM6 300 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp648D3Z0W3 525 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adamtsl5D3Z689 485 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp961E9Q4R5 444 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr608E9Q564 316 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ighg2cF6TQW2 404 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc6a18O88576 615 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccl20O89093 97 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01864 335 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MpzP27573 248 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ear2P97425 156 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ceacam19Q3TQ88 271 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam196aQ3USH1 422 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp235Q499D5 702 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pafah1b3Q61205 232 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cbx5Q61686 191 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc36Q6PDM4 574 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EnkurQ6SP97 255 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1212Q7TR08 311 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1113Q7TR54 326 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Paqr7Q80ZE4 345 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TMEM229BQ8BFQ2 167 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arrb1Q8BWG8 418 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc61Q8R2R5 259 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr777Q8VFH3 311 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pla1aQ8VI78 456 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fdx2Q9CPW2 174 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PsenenQ9CQR7 101 aa5.89□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eef1akmt1Q9CY45 214 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.8 ms