RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635614.1

CD55-211, Transcript of CD55 molecule (Cromer blood group), humanhuman

TSL 5

Gene CD55, Length 1,145 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55-211ENST00000635614 ATP6V1E1P36543 226 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 DAPP51397 102 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 PDCD1Q15116 288 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 DOK3Q7L591 496 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 COMMD2Q86X83 199 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 CMTM4Q8IZR5 234 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 CCDC54Q8NEL0 328 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 TMEM163Q8TC26 289 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 SLC25A28Q96A46 364 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 MED30Q96HR3 178 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 RNF170Q96K19 258 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 IFT22Q9H7X7 185 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 IKZF2Q9UKS7 526 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 LRP12Q9Y561 859 aa8.67□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 OR5B21A6NL26 309 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 ZAR1LA6NP61 321 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 NDUFB3O43676 98 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 PSKH1P11801 424 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 CD80P33681 288 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 CDC42P60953 191 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 GNG3P63215 75 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 FOXL1Q12952 345 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 FAM76BQ5HYJ3 339 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 KRT74Q7RTS7 529 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 LRRC29Q8WV35 223 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 PIGCQ92535 297 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 OR8B4Q96RC9 309 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 SLC6A7Q99884 636 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 JAM3Q9BX67 310 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 CLN6Q9NWW5 311 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.66□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 TMEM89A2RUT3 159 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 ZNF850A8MQ14 1090 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 ZNF879B4DU55 563 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 CLDN34H7C241 214 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 PRKYO43930 277 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 TOX4O94842 621 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 KRT8P05787 483 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 OR2T7P0C7T2 308 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 PRTN3P24158 256 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 PAX2Q02962 417 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 BAMBIQ13145 260 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 PRDX4Q13162 271 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 FAM201AQ5SY85 155 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 C12orf73Q69YU5 71 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 WDR82Q6UXN9 313 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 SLC35F2Q8IXU6 374 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 C3orf56Q8N813 242 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 OR8B12Q8NGG6 310 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 OR2T27Q8NH04 317 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 NPRL2Q8WTW4 380 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 AMELYQ99218 206 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 PKP2Q99959 881 aa8.65□□□□□ -1.02
CD55-211ENST00000635614 ADI1Q9BV57 179 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.1 ms