RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 SNX18Q96RF0 628 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RAB22AQ9UL26 194 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 DIRAS3O95661 229 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TXNDC12O95881 172 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NR2C1P13056 603 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CD53P19397 219 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NTF4P34130 210 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 DLX5P56178 289 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 BIVMQ86UB2 503 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 LRFN5Q96NI6 719 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 DLL4Q9NR61 685 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PRSS50Q9UI38 385 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ACACBO00763 2458 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 YKT6O15498 198 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 RP2O75695 350 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 WISP2O76076 250 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 CA6P23280 308 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 GNRHRP30968 328 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 PTGFRP43088 359 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 UBE2V2Q15819 145 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 COMMD7Q86VX2 200 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 FBXW5Q969U6 566 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 GPR160Q9UJ42 338 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 ETV7Q9Y603 341 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 XRCC2O43543 280 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 IFNA7P01567 189 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 GAAP10253 952 aa6.58□□□□□ -1.36
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PKP4-217ENST00000628904 RAC3P60763 192 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 PSG4Q00888 419 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 ZNF92Q03936 586 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 TLE1Q04724 770 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 DHRS2Q13268 280 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 DOK3Q7L591 496 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.58□□□□□ -1.36
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PKP4-217ENST00000628904 OR2M7Q8NG81 312 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 CDC6Q99741 560 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 PPA2Q9H2U2 334 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 FAM206AQ9NX38 181 aa6.58□□□□□ -1.36
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PKP4-217ENST00000628904 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.58□□□□□ -1.36
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PKP4-217ENST00000628904 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.58□□□□□ -1.36
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PKP4-217ENST00000628904 UNC119Q13432 240 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 RAB12Q6IQ22 244 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 GHITMQ9H3K2 345 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 ICMTO60725 284 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 IGF2P01344 180 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 SERPINF1P36955 418 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 RBP2P50120 134 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-217ENST00000628904 MMP16P51512 607 aa6.57□□□□□ -1.36
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