RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0A6YYJ9 748 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0G2JK05 382 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM157AC9JC47 383 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CD37P11049 281 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF12P17014 697 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL1P22362 96 aa20.5■□□□□ 0.87
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CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZSR3 168 aa20.5■□□□□ 0.87
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CAPNS1-216ENST00000628306 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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CAPNS1-216ENST00000628306 PSG4Q00888 419 aa20.49■□□□□ 0.87
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 SFXN4Q6P4A7 337 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR52H1Q8NGJ2 320 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10AC1Q8NH08 325 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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CAPNS1-216ENST00000628306 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa20.46■□□□□ 0.87
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CAPNS1-216ENST00000628306 LRRTM1Q86UE6 522 aa20.46■□□□□ 0.87
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR51A4Q8NGJ6 313 aa20.46■□□□□ 0.87
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF799Q96GE5 643 aa20.46■□□□□ 0.87
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CAPNS1-216ENST00000628306 VSTM5A8MXK1 200 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNAB3O43448 404 aa20.46■□□□□ 0.87
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CAPNS1-216ENST00000628306 HLA-HP01893 362 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX2P48431 317 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 SCAND1P57086 179 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 LMO4P61968 165 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 DOK3Q7L591 496 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 LRP11Q86VZ4 500 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 OR8B12Q8NGG6 310 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf35Q96D05 121 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CKLFQ9UBR5 152 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GVI7 797 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SYT7O43581 403 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 NCR1O76036 304 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 UBL3O95164 117 aa20.45■□□□□ 0.86
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