RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623935.1

SOX9-AS1-217, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 1,563 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SHISA3A0PJX4 238 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR5B21A6NL26 309 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 AIPO00170 330 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RGS5O15539 181 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NCR1O76036 304 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GOSR1O95249 250 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CYB5AP00167 134 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR4A8P0C604 315 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CA6P23280 308 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HTR2CP28335 458 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SERPINF1P36955 418 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CAV3P56539 151 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR10A3P58181 314 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR8G1Q15617 311 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KISS1Q15726 138 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RAB11BQ15907 218 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF529Q6P280 563 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RNF170Q96K19 258 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CEP19Q96LK0 163 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SYT3Q9BQG1 590 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.31□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SHISA9B4DS77 424 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SLC17A2O00624 439 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CLPXO76031 633 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BMP4P12644 408 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PRF1P14222 555 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ARSBP15848 533 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ADRA2CP18825 462 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TNFSF4P23510 183 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 EVX1P49640 407 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GPM6AP51674 278 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SCAND1P57086 179 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GNG3P63215 75 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RIN1Q13671 783 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HES5Q5TA89 166 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 AWAT2Q6E213 333 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KRT74Q7RTS7 529 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF573Q86YE8 665 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FBXL14Q8N1E6 418 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DIRC2Q96SL1 478 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 A0A075B6Q4 140 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TMEM210A6NLX4 147 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF732B4DXR9 585 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 B9A039 149 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 C19orf84I3L1E1 186 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 M0R233 179 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 UBBP0CG47 229 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TMEM225BP0DP42 221 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CALCBP10092 127 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IGFBP2P18065 325 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF81P51508 661 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GPR176Q14439 515 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ADIPOQQ15848 244 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FAM189A2Q15884 450 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DMRTC1Q5HYR2 192 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FBXW5Q969U6 566 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PHF21AQ96BD5 680 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ITPKCQ96DU7 683 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SPACA5Q96QH8 159 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms