RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZSR6 202 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HTR3DQ70Z44 454 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PDPNQ86YL7 162 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HSD17B8Q92506 261 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 EGLN2Q96KS0 407 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 A0A087X0M5 115 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GX30 115 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 P2RY2P41231 377 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PTGFRP43088 359 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CYB561P49447 251 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 JAG1P78504 1218 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR51B6Q9H340 312 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RECKO95980 971 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NQO2P16083 231 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PAFAH1B2P68402 229 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DYRK2Q92630 601 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MS4A8Q9BY19 250 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GUSBP08236 651 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SHISA4Q96DD7 197 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GPA33Q99795 319 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PSG11Q9UQ72 335 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PPP6CO00743 305 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OPRK1P41145 380 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CST4P01036 141 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RPA2P15927 270 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FABP5Q01469 135 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TWIST1Q15672 202 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PMCHL1Q16048 86 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP5Q16690 384 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FAHD1Q6P587 224 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CHST6Q9GZX3 395 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TBX19O60806 448 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NEURL1O76050 574 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 EPXP11678 715 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CLDN17P56750 224 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 WDFY2Q96P53 400 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GPR37O15354 613 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ACRP10323 421 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LGALS7P47929 136 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PRRX1P54821 245 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 EMP3P54852 163 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PFN4Q8NHR9 129 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 H0YGG7 62 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ST6GAL1P15907 406 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MIDNQ504T8 468 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms